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Enregistrement W3023196397 · doi:10.3390/cells9051130

Single-Cell RNA Sequencing and Its Combination with Protein and DNA Analyses

2020· review· en· W3023196397 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCells · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputational biologyTranscriptomeBiologyDNA sequencingCommercializationGenomicsComputer scienceData scienceGenomeDNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heterogeneity in cell populations poses a significant challenge for understanding complex cell biological processes. The analysis of cells at the single-cell level, especially single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), has made it possible to comprehensively dissect cellular heterogeneity and access unobtainable biological information from bulk analysis. Recent efforts have combined scRNA-seq profiles with genomic or proteomic data, and show added value in describing complex cellular heterogeneity than transcriptome measurements alone. With the rising demand for scRNA-seq for biomedical and clinical applications, there is a strong need for a timely and comprehensive review on the scRNA-seq technologies and their potential biomedical applications. In this review, we first discuss the latest state of development by detailing each scRNA-seq technology, including both conventional and microfluidic technologies. We then summarize their advantages and limitations along with their biomedical applications. The efforts of integrating the transcriptome profile with highly multiplexed proteomic and genomic data are thoroughly reviewed with results showing the integrated data being more informative than transcriptome data alone. Lastly, the latest progress toward commercialization, the remaining challenges, and future perspectives on the development of scRNA-seq technologies are briefly discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,528
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle