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Enregistrement W3023379940 · doi:10.1136/sextrans-2019-sti.353

P206 The specific contribution of each data source in a population-based administrative data cohort from manitoba, canada

2019· article· en· W3023379940 sur OpenAlexaffabout
Souradet Y. Shaw, Leigh M. McClarty, Christine Bibeau, Laurie Ireland, Ken Kasper, Yoav Keynan, Carla Loeppky, Claire Kendall, Marissa Becker

Notice bibliographique

RevuePoster presentations · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueFood Security and Health in Diverse Populations
Établissements canadiensUniversity of OttawaNine Circles Community Health CentreResearch ManitobaManitoba HealthUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortComputer sciencePopulationData scienceMedicineEnvironmental healthInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Background</h3> In the development of administrative data case-definitions for HIV, it is important to understand the contribution of each data source to prevalence estimates, especially as it pertains to generalizability of methods. <h3>Methods</h3> HIV case-definitions were constructed from four population-based databases available in Manitoba: physician claims, hospital discharge, pharmaceutical dispensations, and provincial laboratory tests. Performance was assessed using sensitivity, specificity, positive/negative predictive value (PPV &amp; NPV), and Youden’s index (YI). Cases identified by HIV case-definitions, and those reported to public health surveillance were compared using annualized incidence. The distribution of those flagged as HIV-positive was compared by database. <h3>Results</h3> <h3>The best performing case-definition (YI</h3> 0.71) was two or more HIV diagnoses in two years in physician claims, or in hospital discharge abstracts; or 14 or more HAART dispensations in two years; or one positive HIV laboratory. Sensitivity, specificity, PPV and NPV was 82.3% (95%CI: 79.1%-85.5%), 86.8% (95%CI: 84.9%-88.7%), 74.1% (95%CI: 70.6%-77.6%), 91.4% (95%CI: 89.8%-93.1%), respectively. Annualized incidence (2009–2015) calculated from this case-definition was 7.4/100,000 persons (95%CI: 6.8–8.1)]; annualized incidence calculated from surveillance data was 7.7/100,000 persons (95%CI: 7.1–8.3). Approximately 76% of cases would have been flagged through a positive laboratory; 43% through pharmaceutical claims; 34% through physician claims; and 11% through hospital abstracts. 95% of cases would have been flagged through the combination of laboratory and pharmaceutical databases. Only 4% of cases were flagged in all four data sources. <h3>Conclusion</h3> Although the combination of four databases produced the most complete prevalence snapshot, laboratory data was the most important contributor. The combination of laboratory and pharmaceutical databases would have identified the predominant majority of cases in our sample. Findings can be used to inform the construction of administrative data cohorts where the availability of population-based data sources may be more limited. <h3>Disclosure</h3> No significant relationships.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,102
Score d'incertitude au seuil0,964

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,278
Tête enseignante GPT0,453
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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