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Enregistrement W3023584283 · doi:10.1186/s10020-020-00149-3

EEG-IP: an international infant EEG data integration platform for the study of risk and resilience in autism and related conditions

2020· article· en· W3023584283 sur OpenAlexafffund
Stefon van Noordt, James A. Desjardins, Scott Huberty, Lina Abou-Abbas, Sara Jane Webb, April R. Levin, Sidney J. Segalowitz, Alan C. Evans, Mayada Elsabbagh

Notice bibliographique

RevueMolecular Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensBrock UniversityMcGill University Health CentreMcGill Genome CentreCompute CanadaMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNational Institutes of HealthEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentAutism SpeaksBrock UniversityAzrieli FoundationFondation Brain CanadaAutism Science Foundation
Mots-clésAutismElectroencephalographyComputer scienceAutism spectrum disorderRaw dataData miningArtificial intelligencePsychologyDevelopmental psychologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Establishing reliable predictive and diganostic biomarkers of autism would enhance early identification and facilitate targeted intervention during periods of greatest plasticity in early brain development. High impact research on biomarkers is currently limited by relatively small sample sizes and the complexity of the autism phenotype. METHODS: EEG-IP is an International Infant EEG Data Integration Platform developed to advance biomarker discovery by enhancing the large scale integration of multi-site data. Currently, this is the largest multi-site standardized dataset of infant EEG data. RESULTS: First, multi-site data from longitudinal cohort studies of infants at risk for autism was pooled in a common repository with 1382 EEG longitudinal recordings, linked behavioral data, from 432 infants between 3- to 36-months of age. Second, to address challenges of limited comparability across independent recordings, EEG-IP applied the Brain Imaging Data Structure (BIDS)-EEG standard, resulting in a harmonized, extendable, and integrated data state. Finally, the pooled and harmonized raw data was preprocessed using a common signal processing pipeline that maximizes signal isolation and minimizes data reduction. With EEG-IP, we produced a fully standardized data set, of the pooled, harmonized, and pre-processed EEG data from multiple sites. CONCLUSIONS: Implementing these integrated solutions for the first time with infant data has demonstrated success and challenges in generating a standardized multi-site data state. The challenges relate to annotation of signal sources, time, and ICA analysis during pre-processing. A number of future opportunities also emerge, including validation of analytic pipelines that can replicate existing findings and/or test novel hypotheses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,007
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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