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Enregistrement W3023713429 · doi:10.1212/nxg.0000000000000425

Expanding the phenotypic and molecular spectrum of RNA polymerase III–related leukodystrophy

2020· article· en· W3023713429 sur OpenAlexfundno aff
Stefanie Perrier, Laurence Gauquelin, Catherine Fallet‐Bianco, Megan K. Dishop, Mackenzie A. Michell‐Robinson, Luan T. Tran, Kether Guerrero, Lama Darbelli, Myriam Srour, Kevin Petrecca, Deborah L. Renaud, Michael Saito, Seth A. Cohen, Steffen Leiz, Bader Alhaddad, Tobias B. Haack, Ingrid Tejera-Martin, Fernando Montón, N. Rodríguez-Espinosa, Daniela Pohl, Savithri Nageswaran, Annette Grefe, Emma Glamuzina, Geneviève Bernard

Notice bibliographique

RevueNeurology Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFondation des EtoilesMcGill University
Mots-clésLeukodystrophyPhenotypePolymeraseGeneticsBiologyVirologyMedicineGenePathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To expand the phenotypic spectrum of severity of POLR3-related leukodystrophy and identify genotype-phenotype correlations through study of patients with extremely severe phenotypes. Methods We performed an international cross-sectional study on patients with genetically proven POLR3-related leukodystrophy and atypical phenotypes to identify 6 children, 3 males and 3 females, with an extremely severe phenotype compared with that typically reported. Clinical, radiologic, and molecular features were evaluated for all patients, and functional and neuropathologic studies were performed on 1 patient. Results Each patient presented between 1 and 3 months of age with failure to thrive, severe dysphagia, and developmental delay. Four of the 6 children died before age 3 years. MRI of all patients revealed a novel pattern with atypical characteristics, including progressive basal ganglia and thalami abnormalities. Neuropathologic studies revealed patchy areas of decreased myelin in the cerebral hemispheres, cerebellum, brainstem, and spinal cord, with astrocytic gliosis in the white matter and microglial activation. Cellular vacuolization was observed in the thalamus and basal ganglia, and neuronal loss was evident in the putamen and caudate. Genotypic similarities were also present between all 6 patients, with one allele containing a POLR3A variant causing a premature stop codon and the other containing a specific intronic splicing variant (c.1771-7C>G), which produces 2 aberrant transcripts along with some wild-type transcript. Conclusions We describe genotype-phenotype correlations at the extreme end of severity of the POLR3-related leukodystrophy spectrum and shed light on the complex disease pathophysiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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