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Enregistrement W3023783526 · doi:10.1055/s-0040-1710524

Whole-Exome Sequencing in NF1-Related West Syndrome Leads to the Identification of KCNC2 as a Novel Candidate Gene for Epilepsy

2020· article· en· W3023783526 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNeuropediatrics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensVancouver General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpilepsyExome sequencingMedicineNeurofibromatosisWest SyndromeExomeEtiologyEpilepsy syndromesLoss functionCohortGeneticsBioinformaticsPhenotypeInternal medicineGenePathologyBiologyPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Patients with neurofibromatosis type 1 (NF1) have an increased risk for West syndrome (WS), but the underlying mechanisms linking NF1 and WS are unknown. In contrast to other neurocutaneous syndromes, intracerebral abnormalities explaining the course of infantile spasms (IS) are often absent and the seizure outcome is usually favorable. Several studies have investigated a potential genotype–phenotype correlation between NF1 and seizure susceptibility, but an association was not identified. Therefore, we identified three patients with NF1-related WS (NF1-WS) in a cohort of 51 NF1 patients and performed whole-exome sequencing (WES) to identify genetic modifiers. In two NF1 patients with WS and good seizure outcome, we did not identify variants in epilepsy-related genes. However, in a single patient with NF1-WS and transition to drug-resistant epilepsy, we identified a de novo variant in KCNC2 (c.G499T, p.D167Y) coding for Kv3.2 as a previously undescribed potassium channel to be correlated to epilepsy. Electrophysiological studies of the identified KCNC2 variant demonstrated both a strong loss-of-function effect for the current amplitude and a gain-of-function effect for the channel activation recommending a complex network effect. These results suggest that systematic genetic analysis for potentially secondary genetic etiologies in NF1 patients and severe epilepsy presentations should be done.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,799
Score d'incertitude au seuil0,556

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle