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Enregistrement W3023840285 · doi:10.3201/eid2606.190233

Increased Community-Associated <i>Clostridioides difficile</i> Infections in Quebec, Canada, 2008–20151

2020· article· en· W3023840285 sur OpenAlexafffundabout
Veronica Zanichelli, Christophe Garenc, Jasmin Villeneuve, Danielle Moisan, Charles Frenette, Vivian G. Loo, Yves Longtin

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensInstitut National de Santé Publique du QuébecCégep de Rivière-du-LoupJewish General HospitalCentre hospitalier universitaire de QuébecMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesInstitut National de Santé Publique du Québec
Mots-clésClostridioidesMedicineClostridium difficileMicrobiologyEnvironmental healthInternal medicineBiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

C lostridioides difficile infections (CDIs) are com- monly acquired in healthcare settings (1).In 2003, an outbreak of CDI in the province of Quebec, Canada (population, 8.2 million), required implementation of mitigation strategies and prompted introduction of a surveillance program (2,3).Afterward, incidence of healthcare-associated CDIs (HA-CDIs) in the province decreased from 13.7 cases/10,000 patient-days in 2004-2005 to 6.9/10,000 patient-days in 2014-2015.Although CDIs afflict mainly hospitalized patients, recent studies report increased incidence of community-associated CDIs (CA-CDIs) (4-6).Whereas most of the focus in North America has been on HA-CDI, we describe and compare long-term trends in incidence rates for HA-CDI and CA-CDI in Quebec. The StudyTo evaluate HA-CDI and CA-CDI trends in Quebec, we performed a quasi-experimental study.We used prospectively collected data from the Quebec Health Ministry C. difficile Infection Surveillance Program (SPIN-CD), a mandatory surveillance program introduced in 2004 (7).As of 2018, all 90 acute-care hospitals with >1,000 admissions annually participate in SPIN-CD.These hospitals, which represent 97% of all admissions in the province, use a centralized web portal to report HA-CDI incidence density, computed as the aggregate number of cases divided by the aggregate number of patient-days per 4-week period.CA-CDI incidence rates are expressed as the number of CA-CDIs/100,000 population as reported by the Quebec Institute of Statistics (8).CDI is defined as diarrhea (>3 unformed stools in <24 hours with symptoms lasting >24 hours) with no other etiology and either a positive toxigenic C. difficile test result or evidence of pseudomembranes during histopathologic or colonoscopic examination (9).A case is considered to be HA-CDI if symptoms appear >72 hours after admission or <4 weeks after discharge.A CA-CDI case is defined as illness in a hospitalized patient for whom symptoms developed within 72 hours of admission and who had not been hospitalized or received ambulatory care in the previous 4 weeks.Nonhospitalized CA-CDI case-patients and recurrences (i.e., new CDI episodes within 8 weeks of a previous episode) are not reportable to SPIN-CD.Definitions did not change during the study period.The type of laboratory assay used to detect C. difficile was at the discretion of each center (10).To focus the analysis on the postepidemic period (April 2008-March 2015), we excluded data from the epidemic period (August 2004-March 2008). We used Poisson regression models on time series Increased Community-Associated Clostridioides difficile Infections in

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,428

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,005
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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