SUN-LB130 Identification of IGSF1 Ligands
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Immunoglobulin superfamily, member 1 (IGSF1), is an X-linked, type 1 transmembrane glycoprotein that is highly expressed in the anterior pituitary gland and testes. Mutations in the IGSF1 gene cause congenital central hypothyroidism, variable hypoprolactinemia, growth hormone dysregulation, and macroorchidism. Igsf1 knockout mice exhibit reduced pituitary TRH receptor (Trhr1) expression with an associated impairment in TRH-stimulated TSH secretion. The mechanism through which IGSF1 loss leads to reductions in Trhr1 levels is unresolved, at least in part because IGSF1’s cellular functions are unknown. The mature form of the IGSF1 protein consists of seven extracellular Ig loops, a single transmembrane domain containing a positively charged arginine, and a short intracellular carboxy-tail devoid of known functional motifs. Recently, IGSF1 was argued to be a member of the leukocyte receptor cluster (LRC) family. LRC proteins act as cell surface receptors for soluble or membrane-bound proteins. We therefore hypothesized that IGSF1 is a cell surface receptor for a presently undescribed ligand that regulates Trhr1 expression in pituitary thyrotrope cells. To identify candidate IGSF1 ligands, we implemented a new ligand trapping method, Ecto-Fc MS. We fused the extracellular (Ecto) domain of IGSF1 to the fragment crystallizable (Fc) region of human IgG, creating an Ecto-Fc fusion protein. Secreted IGSF1-Fc was purified and used as a ligand trap for bait proteins extracted from rat testes. The protein complexes were affinity purified with protein A beads, trypsin digested into peptides, subjected to orthogonal high-pH fractionation, and identified by tandem LC-MS/MS. More than 700 proteins were enriched in IGSF1-Fc preparations compared to an Fc-only negative control. Several secreted ligands and plasma-membrane proteins were identified, many of which are also expressed in pituitary thyrotrope cells. Identifying the ligand or ligands will enable us to determine IGSF1 function, and may lead to the discovery of novel causes of central hypothyroidism and macroorchidism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».