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Enregistrement W3024083990 · doi:10.1038/s41598-020-64824-5

3D-MCN: A 3D Multi-scale Capsule Network for Lung Nodule Malignancy Prediction

2020· article· en· W3024083990 sur OpenAlexafffund
Parnian Afshar, Anastasia Oikonomou, Farnoosh Naderkhani, Pascal N. Tyrrell, Konstantinos N. Plataniotis, Keyvan Farahani, Arash Mohammadi

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreConcordia University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésMalignancyNodule (geology)Convolutional neural networkComputer scienceLung cancerInterpretabilityArtificial intelligenceScale (ratio)Artificial neural networkMachine learningMedicinePathologyBiologyCartography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the advances in automatic lung cancer malignancy prediction, achieving high accuracy remains challenging. Existing solutions are mostly based on Convolutional Neural Networks (CNNs), which require a large amount of training data. Most of the developed CNN models are based only on the main nodule region, without considering the surrounding tissues. Obtaining high sensitivity is challenging with lung nodule malignancy prediction. Moreover, the interpretability of the proposed techniques should be a consideration when the end goal is to utilize the model in a clinical setting. Capsule networks (CapsNets) are new and revolutionary machine learning architectures proposed to overcome shortcomings of CNNs. Capitalizing on the success of CapsNet in biomedical domains, we propose a novel model for lung tumor malignancy prediction. The proposed framework, referred to as the 3D Multi-scale Capsule Network (3D-MCN), is uniquely designed to benefit from: (i) 3D inputs, providing information about the nodule in 3D; (ii) Multi-scale input, capturing the nodule's local features, as well as the characteristics of the surrounding tissues, and; (iii) CapsNet-based design, being capable of dealing with a small number of training samples. The proposed 3D-MCN architecture predicted lung nodule malignancy with a high accuracy of 93.12%, sensitivity of 94.94%, area under the curve (AUC) of 0.9641, and specificity of 90% when tested on the LIDC-IDRI dataset. When classifying patients as having a malignant condition (i.e., at least one malignant nodule is detected) or not, the proposed model achieved an accuracy of 83%, and a sensitivity and specificity of 84% and 81% respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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