Characterization of miRNAs modulated by torpor in the hibernating ground squirrel Ictidomys tridecemlineatus liver by next-generation sequencing.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Mammalian hibernation is a fascinating phenomenon that involves multiple molecular and biochemical changes to proceed. While the molecular picture associated with torpor has become clearer in recent years, the function of non-coding RNAs, and especially of microRNAs, solicited during this process is not well understood. OBJECTIVE: To better characterize a signature of cold torpor-associated miRNAs in the hibernating thirteen-lined ground squirrel Ictidomys tridecemlineatus. MATERIALS AND METHODS: Next-generation sequencing and qRT-PCR approaches were conducted in euthermic and hibernating ground squirrel liver tissues. RESULTS: This high-throughput approach notably revealed modulation during hibernation of various miRNAs previously associated with lipid metabolism, glucose metabolism and antioxidant responses such as miR-145a-3p, miR-22-3p and miR-25-3p, respectively. CONCLUSION: Overall, these results present a group of miRNAs differentially expressed in hibernating ground squirrel liver and provide additional knowledge on the underlying functions of these small non-coding molecules during cold torpor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».