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Enregistrement W3024379713 · doi:10.1101/2020.05.12.092072

The eIF2α kinase HRI triggers the autophagic clearance of cytosolic protein aggregates

2020· preprint· en· W3024379713 sur OpenAlexafffund
Mena Abdel‐Nour, Valeria Ramaglia, Athanasia A. Bianchi, Jessica Tsalikis, Hien N. Chau, Suneil K. Kalia, Lorraine V. Kalia, Jane-Jane Chen, Damien Arnoult, Jennifer L. Gommerman, Dana J. Philpott, Stephen E. Girardin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Ottawa
Mots-clésAggresomeProteotoxicityProtein aggregationCell biologyStress granuleProteasomeCytosolTFEBAutophagyUbiquitinChemistryBiologyTranslation (biology)ApoptosisBiochemistryMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Large cytosolic protein aggregates are removed by two main cellular processes, autophagy and the ubiquitin-proteasome system (UPS), and defective clearance of these protein aggregates results in proteotoxicity and cell death. Here we show that the eIF2α kinase HRI potentiates the autophagic clearance of cytosolic protein aggregates when the UPS is inhibited. In cells silenced for HRI, proteasome inhibition resulted in accumulation of aggresomes and ubiquitinated proteins, as well as cytotoxicity. Moreover, silencing of HRI resulted in cytotoxic accumulation of over-expressed α-synuclein, a protein known to aggregate in Parkinson’s disease, dementia with Lewy bodies, and multiple system atrophy. In agreement, protein aggregate accumulation and microglia activation were observed in the spinal cord white matter of 7-month old Hri -/- mice as compared to Hri +/+ littermates. Moreover, aged Hri -/- mice showed accumulation of misfolded α-synuclein, indicative of misfolded proteins, in the lateral collateral pathway, a region of the sacral spinal cord horn that receives visceral sensory afferents from the bladder and distal colon, a pathological feature common to α-synucleinopathies in humans where it may contribute to impaired micturition and/or constipation. Together, these results suggest that HRI contributes to a general cytosolic unfolded protein response (cUPR) that could be leveraged to bolster the clearance of cytotoxic protein aggregates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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