MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3024576864 · doi:10.1149/ma2020-01332395mtgabs

Detection of Cancer Exosomes By a Localized Surface Plasmon Resonance Method Using Gold Nano-Islands

2020· article· en· W3024576864 sur OpenAlexaff
Duraichelvan Raju, Srinivas Bathini, Simona Bǎdilescu, Shanmugasundaram Pakkiriswami, Rodney J. Ouellette, Anupam Ghosh, Muthukumaran Packirisamy

Notice bibliographique

RevueECS Meeting Abstracts · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensAtlantic Cancer Research InstituteConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSurface plasmon resonanceColloidal goldBiomoleculeNanoparticleMicrovesiclesMaterials scienceNanotechnologyNano-PlasmonChemistryOptoelectronicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Noble metals have a most important property, the Localized Surface Plasmon Resonance (LSPR) that can be tuned by changing the size and shape of the nanoparticles. This property is useful to perform any real-time label-free monitoring of biomolecular interactions, by measuring the shift of the Plasmon band towards longer wavelengths due to the change in the local refractive index upon molecule binding [1, 2]. Exosomes are nano-sized particles (30-100 nm) released to the extracellular space by all cells in large numbers, prospective biomarkers for early-stage cancer diagnosis [3-5]. The aim of the present study is the detection and capture of exosomes, by using (1) a synthetic peptide and (2) antibodies specific to the surface proteins of exosomes. In both approaches, the biomolecules are immobilized on gold (Au) nano-islands. The first approach makes use of a synthetic polypeptide Vn96 (Venceremin) that has a high affinity towards the heat shock proteins present on the surface of exosomes. The second approach is based on the antibodies (CD63, CD81 and CD9) that are specific to the proteins present on the surface of exosomes. Method The gold nano-islands are fabricated by the thermal convection of ex-situ synthesized gold nanoparticles, followed by the heat treatment of substrates at 560oC to tune the size and shape of the particles. Au nano-islands are initially functionalized by 11-mercaptoundecanoic acid (Nanothink) to form a self-assembled monolayer. This layer is activated, using a cross-linker, which is a mixture of N-(3-dimethylaminopropyl)-N′-ethylcarbodiimide hydrochloride (EDC) and N-Hydroxysuccinimide (NHS) in the ratio of 1:1. The activated layer is coated with streptavidin to bind, biotinylated Vn96 peptide to capture exosomes whereas, in the antibody-based approach, streptavidin-biotin step is replaced with the antibodies. To the immobilized molecules of polypeptide/antibody (anti-CD63/81), MCF7 (breast cancer cell line) cell culture conditioned media, containing EVs/exosomes is added. At each successive functionalization and immobilization step, the position of the Au plasmon band in the UV-Visible spectrum is measured and the corresponding shift is calculated. Results The preliminary results obtained by using the two protocols indicate that both approaches have the capability to detect and capture the exosomes for cancer diagnosis. The wavelength shift observed in the antibody-based approach, is relatively higher, compared to the one observed when Vn96 was used to capture the exosomes. By using specifically, the anti-CD63 antibody, there is at least an appreciable increase in the wavelength shift, compared to Vn96 polypeptide. In addition, the sensing protocol can be simplified and the detection can be carried out in a shorter time. Conclusions The quantification of exosomes has been performed by using two different LSPR methods. One approach uses the Vn96 peptide for the capture of exosomes, while the other, makes use of the antibodies corresponding to surface proteins. Both methods provided reliable results. However, the method using antibodies results in a larger shift of the Plasmon band showing a stronger interaction and the method can be carried out in a shorter time. References Nath and A. Chilkoti, “Label-free biosensing by surface plasmon resonance of nanoparticles on glass: optimization of nanoparticle size," Anal. Chem., vol. 76, pp. 5370-5378, 2004 Nath and A. Chilkoti, “Label free colorimetric biosensing using nanoparticles,” J. Fluoresc., vol. 14, pp. 377-389, 2004. María Yáñez-Mó, Pia R.-M. Siljander, Zoraida Andreu, Apolonija Bedina Zavec, Francesc E. Borràs, et al., “Biological properties of extracellular vesicles and their physiological functions,” Journal of Extracellular Vesicles, vol.4: 27066, 2015. Gregor Fuhrmann, Inge K. Herrmann, and Molly M. Stevensa, “Cell-derived vesicles for drug therapy and diagnostics: Opportunities and challenges,” Nano Today, vol.10, pp.397—409, 2015. Bathini, D. Raju, S. Badilescu, et al., “Nano–Bio Interactions of Extracellular Vesicles with Gold Nanoislands for Early Cancer Diagnosis,” Research, vol. 2018, Article ID 3917986, 10 pages, 2018.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueECS Meeting AbstractsMême sujetExtracellular vesicles in diseaseTravaux en français237 207