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Enregistrement W3024601170 · doi:10.1073/pnas.1922207117

Transcriptional profiling identifies an androgen receptor activity-low, stemness program associated with enzalutamide resistance

2020· article· en· W3024601170 sur OpenAlexaff
Joshi J. Alumkal, Duanchen Sun, Eric Lu, Tomasz M. Beer, George Thomas, Emile Latour, Rahul Aggarwal, Jeremy Cetnar, Charles J. Ryan, Shaadi Tabatabaei, Shawna Bailey, Claire B. Turina, David A. Quigley, Xiangnan Guan, Adam Foye, Jack Youngren, Joshua A. Urrutia, Jiaoti Huang, Alana S. Weinstein, Verena Friedl, Matthew B. Rettig, Robert E. Reiter, Daniel E. Spratt, Martin Gleave, Christopher P. Evans, Joshua M. Stuart, Yiyi Chen, Felix Y. Feng, Eric J. Small, Owen N. Witte, Zheng Xia

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteComprehensive Cancer Center, University of MichiganU.S. Department of DefenseStand Up To CancerJanssen BiotechAstellas PharmaUniversity of Michigan
Mots-clésEnzalutamideAndrogen receptorProstate cancerCancer researchMedicineAndrogenClinical trialOncologyInternal medicineBiologyCancerHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance The androgen receptor (AR) antagonist enzalutamide is one of the principal treatments for men with metastatic castration-resistant prostate cancer. However, not all patients respond, and de novo resistance mechanisms are largely unknown. To clarify mechanisms that contribute to enzalutamide resistance, we conducted a single-arm enzalutamide clinical trial. Metastatic tissue biopsies were required prior to study entry so we could attempt to identify molecular features associated with de novo resistance. Transcriptional profiling identified specific gene sets—including those linked to reduced AR transcriptional activity and a stemness program—that were activated in nonresponders. Our results suggest that patients whose tumors harbor this program should be considered for clinical trials testing rational agents to overcome de novo enzalutamide resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations169
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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