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Enregistrement W3024791965 · doi:10.3390/ijms21103499

Identification and Characterization of Verticillium longisporum Lineage A1/D1 from Brassica Crops in Manitoba, Canada

2020· article· en· W3024791965 sur OpenAlexafffundabout
Zhongwei Zou, Vikram Bisht, W. G. Dilantha Fernando

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural DevelopmentUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of California, DavisSaskatchewan Canola Development Commission
Mots-clésCanolaVerticillium dahliaeBiologyVerticilliumBrassicaRaphanusBotanyVerticillium wiltConidium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Verticillium stripe in canola (Brassica napus L.) caused by Verticillium longisporum was first reported in Manitoba in 2014. In this study, Brassica crops including canola, mustard (Brassica juncea) and radish (Raphanus sativus) with visible symptoms of Verticillium stripe were collected from Portage La Prairie, Manitoba, and the pathogens were isolated. Isolates from canola and radish were identified to V. longisporum, which produced longer conidia (7.92–12.00 µm) than Verticillium dahliae (4.32–7.04 µm). An isolate derived from mustard was characterized as V. dahliae. Molecular diagnostics with 18S rDNA, 5.8S rDNA and mating-type marker primers were used to confirm the identification of Verticillium isolates. PCR-RFLP of the mitochondrial small subunit rDNA and the cytochrome b gene were also employed to distinguish V. longisporum isolates from V. dahliae. The multi-gene characterization approach allowed for lineage determination, and V. longisporum isolates from canola and radish were in the A1/D1 group. Isolates of Verticillium longisporum from canola inoculated onto the canola cultivar ‘Westar’ caused symptoms of stem striping, stunting and short plants. Re-isolated fungal strains from infected stems were again inoculated onto canola plants, in order to confirm that V. longisporum was the causal agent of Verticillium stripe disease in the pathogenicity test.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,296

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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