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Enregistrement W3024930800 · doi:10.3391/mbi.2020.11.2.03

Environmental DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach

2020· article· en· W3024930800 sur OpenAlexaboutno aff
Francis LeBlanc, Valérie Belliveau, Erica Watson, Chantal Coomber, Nathalie Simard, Claudio DiBacco, Renée Bernier, Nellie Gagné

Notice bibliographique

RevueManagement of Biological Invasions · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInterregNatural Environment Research CouncilLeuphana Universität Lüneburg
Mots-clésEnvironmental DNABiologyInvasive speciesAquatic environmentEcologyFisheryBiodiversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ireland, being an island situated on Europe's western seaboard, has a fewer number of native species than mainland European Union Member States (MS).Increased numbers of vectors and pathways have reduced the island's biotic isolation, increasing the risk of new introductions and their associated impacts on native biodiversity.It is likely that these risks are greater here than they are in continental MSs, where the native biodiversity is richer.A horizon scanning approach was used to identify the most likely invasive alien species (IAS) (with the potential to impact biodiversity) to arrive on the island of Ireland within the next ten years.To achieve this, we used a consensus-based approach, whereby expert opinion and discussion groups were utilised to establish and rank a list of 40 species of the most likely terrestrial, freshwater and marine IAS to arrive on the island of Ireland within the decade 2017-2027.The list of 40 included 18 freshwater, 15 terrestrial and seven marine IAS.Crustacean species (freshwater and marine) were taxonomically dominant (11 out of 40); this reflects their multiple pathways of introduction, their ability to act as ecosystem engineers and their resulting high impacts on biodiversity.Freshwater species dominated the top ten IAS (seven species out of ten), with the signal crayfish (Pacifastacus leniusculus) highlighted as the most likely species to arrive and establish in freshwaters, while roe deer (Capreolus capreolus) (second) and the warm-water barnacle (Hesperibalanus fallax) (fifth), were the most likely terrestrial and marine invaders.This evidence-based list provides important information to the relevant statutory agencies in both the Republic of Ireland and Northern Ireland to prioritise the prevention of the most likely invaders and aid in compliance with legislation, in particular the EU Regulation on Invasive Alien Species (EU 1143/2014).Targeted biosecurity in both jurisdictions is urgently required in order to manage the pathways and vectors of arrival, and is vital to maintaining native biodiversity on the island of Ireland.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,244
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,099 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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