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Enregistrement W3024966196 · doi:10.1038/s41467-020-16199-4

Targeting lysyl oxidase (LOX) overcomes chemotherapy resistance in triple negative breast cancer

2020· article· en· W3024966196 sur OpenAlexafffund
Özge Saatci, Aysegül Kaymak, Umar Raza, Pelin G. Ersan, Özge Akbulut, Carolyn E. Banister, Vitali Sikirzhytski, Ünal Metin Tokat, Gamze Aykut, Suhail A. Ansari, Hayriye Tatlı Doğan, Mehmet Doğan, Pouria Jandaghi, Aynur Işık, Fatma Gündoğdu, Kemal Kösemehmetoğlu, Ömer Dızdar, Sercan Aksoy, Aytekin Akyol, Ayşegül Üner, Phillip Buckhaults, Yasser Riazalhosseini, Özgür Şahin

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial metabolism and enzyme function
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University and Génome Québec Innovation Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéHigher Education Commision, PakistanEuropean CommissionEuropean Molecular Biology OrganizationAmerican Cancer SocietyNational Institute of General Medical SciencesUniversity of South CarolinaNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésLysyl oxidaseTriple-negative breast cancerCancer researchBreast cancerHIF1ABiologyCancerExtracellular matrixMedicineAngiogenesisInternal medicineCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemoresistance is a major obstacle in triple negative breast cancer (TNBC), the most aggressive breast cancer subtype. Here we identify hypoxia-induced ECM re-modeler, lysyl oxidase (LOX) as a key inducer of chemoresistance by developing chemoresistant TNBC tumors in vivo and characterizing their transcriptomes by RNA-sequencing. Inhibiting LOX reduces collagen cross-linking and fibronectin assembly, increases drug penetration, and downregulates ITGA5/FN1 expression, resulting in inhibition of FAK/Src signaling, induction of apoptosis and re-sensitization to chemotherapy. Similarly, inhibiting FAK/Src results in chemosensitization. These effects are observed in 3D-cultured cell lines, tumor organoids, chemoresistant xenografts, syngeneic tumors and PDX models. Re-expressing the hypoxia-repressed miR-142-3p, which targets HIF1A, LOX and ITGA5, causes further suppression of the HIF-1α/LOX/ITGA5/FN1 axis. Notably, higher LOX, ITGA5, or FN1, or lower miR-142-3p levels are associated with shorter survival in chemotherapy-treated TNBC patients. These results provide strong pre-clinical rationale for developing and testing LOX inhibitors to overcome chemoresistance in TNBC patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations364
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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