Hippocampal transcriptome analysis following maternal separation implicates altered RNA processing in a mouse model of fetal alcohol spectrum disorder
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Fetal alcohol spectrum disorders (FASD) are common, seen in 1-5% of the population in the USA and Canada. Children diagnosed with FASD are not likely to remain with their biological parents, facing early maternal separation and foster placements throughout childhood. METHODS: We model FASD in mice via prenatal alcohol exposure and further induce early life stress through maternal separation. We use RNA-seq followed by clustering of expression profiles through weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) to analyze transcriptomic changes that result from the treatments. We use reverse transcription qPCR to validate these changes in the mouse hippocampus. RESULTS: We report an association between adult hippocampal gene expression and prenatal ethanol exposure followed by postnatal separation stress that is related to behavioral changes. Expression profile clustering using WGCNA identifies a set of transcripts, module 19, associated with anxiety-like behavior (r = 0.79, p = 0.002) as well as treatment group (r = 0.68, p = 0.015). Genes in this module are overrepresented by genes involved in transcriptional regulation and other pathways related to neurodevelopment. Interestingly, one member of this module, Polr2a, polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, is downregulated by the combination of prenatal ethanol and postnatal stress in an RNA-Seq experiment and qPCR validation (q = 2e-12, p = 0.004, respectively). CONCLUSIONS: Together, transcriptional control in the hippocampus is implicated as a potential underlying mechanism leading to anxiety-like behavior via environmental insults. Further research is required to elucidate the mechanism involved and use this insight towards early diagnosis and amelioration strategies involving children born with FASD.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle