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Enregistrement W3025151675 · doi:10.1016/j.isci.2020.101159

Purification and Structural Characterization of Aggregation-Prone Human TDP-43 Involved in Neurodegenerative Diseases

2020· article· en· W3025151675 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueiScience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMotor Neurone Disease Association
Mots-clésCleavage (geology)Small moleculeChemistryRecombinant DNAProtein aggregationBiophysicsAlanineCharacterization (materials science)MoleculeCrystallographyBiochemistryAmino acidBiologyNanotechnologyMaterials scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mislocalization, cleavage, and aggregation of the human protein TDP-43 is found in many neurodegenerative diseases. As is the case with many other proteins that are completely or partially structurally disordered, production of full-length recombinant TDP-43 in the quantities necessary for structural characterization has proved difficult. We show that the full-length TDP-43 protein and two truncated N-terminal constructs 1-270 and 1-263 can be heterologously expressed in E. coli. Full-length TDP-43 could be prevented from aggregation during purification using a detergent. Crystals grown from an N-terminal construct (1-270) revealed only the N-terminal domain (residues 1-80) with molecules arranged as parallel spirals with neighboring molecules arranged in head-to-tail fashion. To obtain detergent-free, full-length TDP-43 we mutated all six tryptophan residues to alanine. This provided sufficient soluble protein to collect small-angle X-ray scattering data. Refining relative positions of individual domains and intrinsically disordered regions against this data yielded a model of full-length TDP-43.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,831
Score d'incertitude au seuil0,186

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle