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Enregistrement W3025505370 · doi:10.1101/2020.05.11.20098376

Symptom-based ordinal scale fuzzy clustering of functional gastrointestinal disorders

2020· preprint· en· W3025505370 sur OpenAlexafffund
Marjan Mansourian, Hamid Reza Marateb, Ammar Hassanzadeh Keshteli, Hamed Daghagh Zadeh, Miguel Ángel Mañanas, Peyman Adibi

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastrointestinal motility and disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesEuropean CommissionMcGill University
Mots-clésIrritable bowel syndromeConstipationMedicineCluster (spacecraft)EpidemiologyFunctional constipationInternal medicineComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background The validity of Rome III criteria for diagnosing functional gastrointestinal disorders (FGIDs) have been frequently questioned in the literature. In epidemiology, when a disease is diagnosed, the existence of a true cluster must be proven. Thus, clustering the common GI symptoms of individuals and comparing the clusters with FGIDs defined by the Rome III criteria could provide insights about the validity of FGIDs defined by those criteria. Well-separated compact clusters were detected in responses to questionnaires of the epidemiological features of different FGIDs in Iranian adults using fuzzy ordinal clustering. The representative sample from each cluster i.e. Cluster Representative (CR) was formed whose corresponding FGID was diagnosed with Rome III criteria. Then, FGID diagnosis was performed for all participants in each cluster and the percentage of cases whose FGID was the same as the cluster's identified FGID (agreement) was reported. Results Fourteen valid clusters were detected in 4763 people. The average membership of the objects in each cluster was 77.3%, indicating similarity of the objects in clusters to their corresponding CRs. Eight clusters were assigned to single FGIDs (irritable bowel syndromes: constipation IBS-C, diarrhea IBS-D and un-subtyped IBS-U; functional bloating FB; functional constipation FC; belching disorder BD. The agreement was higher than 50% in single FGID clusters except those whose diagnosis was IBS-U. Conclusions IBS-C, IBS-D, FC, BD, and FB defined with Rome III criteria exist in the population, which is not the case for IBS-U.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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