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Enregistrement W3025778144 · doi:10.1161/circgen.119.002710

FADS1 (Fatty Acid Desaturase 1) Genotype Associates With Aortic Valve FADS mRNA Expression, Fatty Acid Content and Calcification

2020· article· en· W3025778144 sur OpenAlexaff
Oscar Plunde, Susanna C. Larsson, Gonzalo Artiach, George Thanassoulis, Miguel Carracedo, Anders Franco‐Cereceda, Per Eriksson, Magnus Bäck

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFatty Acid Research and Health
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFADS2BiologyDocosahexaenoic acidFatty acid desaturaseInternal medicineFatty acidEndocrinologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphismGeneticsBiochemistryMedicinePolyunsaturated fatty acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Aortic stenosis (AS) contributes to cardiovascular mortality and morbidity but disease mechanisms remain largely unknown. Recent evidence associates a single nucleotide polymorphism rs174547 within the FADS1 gene, encoding FADS1 (fatty acid desaturase 1), with risk of several cardiovascular outcomes, including AS. FADS1 encodes a rate-limiting enzyme for ω-3 and ω-6 fatty acid metabolism. The aim of this study was to decipher the local transcriptomic and lipidomic consequences of rs174547 in tricuspid aortic valves from patients with AS. Methods: Expression quantitative trait loci study was performed using data from Illumina Human610-Quad BeadChip, Infinium Global Screening Arrays, and Affymetrix Human Transcriptome 2.0 arrays in calcified and noncalcified aortic valve tissue from 58 patients with AS (mean age, 74.2; SD, 5.9). Fatty acid content was assessed in aortic valves from 25 patients with AS using gas chromatography. Δ 5 and Δ 6 desaturase activity was assessed by the product-to-precursor ratio. Results: The minor C-allele of rs174547, corresponding to the protective genotype for AS, was associated with higher FADS2 mRNA levels in calcified valve tissue, whereas FADS1 mRNA and other transcripts in proximity of the single nucleotide polymorphism were unaltered. In contrast, the FADS1 Δ 5-desaturase activity and the FADS2 Δ 6-desaturase activity were decreased. Finally, docosahexaenoic acid was decreased in calcified tissue compared with non-calcified tissue and C-allele carriers exhibited increased docosahexaenoic acid levels. Overall desaturase activity measured with ω-3 fatty acids was higher in C-allele carriers. Conclusions: The association between the FADS1 genotype and AS may implicate effects on valvular fatty acids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,841
Score d'incertitude au seuil0,739

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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