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Enregistrement W3025838528 · doi:10.1128/aem.00778-20

Ancestral Resurrection and Directed Evolution of Fungal Mesozoic Laccases

2020· article· en· W3025838528 sur OpenAlexaff
Bernardo J. Gómez-Fernández, Valeria A. Risso, Andrés M. Rueda, José M. Sánchez‐Ruiz, Miguel Alcalde

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEnzyme-mediated dye degradation
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesHorizon 2020 Framework ProgrammeEuropean CommissionMinisterio de Ciencia, Innovación y Universidades
Mots-clésMesozoicLaccaseBiologyEvolutionary biologyPaleontologyEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The broad variety of biotechnological uses of fungal laccases is beyond doubt (food, textiles, pulp and paper, pharma, biofuels, cosmetics, and bioremediation), and protein engineering (in particular, directed evolution) has become the key driver for adaptation of these enzymes to harsh industrial conditions. Usually, the first requirement for directed laccase evolution is heterologous expression, which presents an important hurdle and often a time-consuming process. In this work, we resurrected a fungal Mesozoic laccase node which showed strikingly high heterologous expression and pH stability. As a proof of concept that the ancestral laccase is a suitable blueprint for engineering, we performed a quick directed evolution campaign geared to the oxidation of the β-diketone 1,3-cyclopentanedione, a poor laccase substrate that is used in the polymerization of vinyl monomers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,801
Score d'incertitude au seuil0,162

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,154
Écart entre enseignants0,146 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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