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Enregistrement W3025916786 · doi:10.1371/journal.pone.0232205

Two new sponge species (Demospongiae: Chalinidae and Suberitidae) isolated from hyperarid mangroves of Qatar with notes on their potential antibacterial bioactivity

2020· article· en· W3025916786 sur OpenAlexaff
Bruno Welter Giraldes, Claire Goodwin, Noora A. A. Al-Fardi, Amanda Engmann, Alexandra Leitão, Asma A. Ahmed, Kamelia O. Ahmed, Hadil A. Abdulkader, Halah A. Al-Korbi, Hala Sultan Saif Al Easa, Nahla O. Eltai, Pejman Hanifi-Moghaddam

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensHuntsman Marine Science CentreUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesQatar National LibraryQatar National Research FundQatar UniversityFonds National de la Recherche LuxembourgQatar Foundation
Mots-clésAerial rootMangroveBiologySpongeSeagrassEcologyBotanyEcosystem

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study presents the taxonomic description of two new sponge species that are intimately associated with the hyperarid mangrove ecosystem of Qatar. The study includes a preliminary evaluation of the sponges' potential bioactivity against pathogens. Chalinula qatari sp. nov. is a fragile thinly encrusting sponge with a vivid maroon colour in life, often with oscular chimneys and commonly recorded on pneumatophores in the intertidal and shallow subtidal zone. Suberites luna sp. nov. is a massive globular-lobate sponge with a greenish-black colour externally and a yellowish orange colour internally, recorded on pneumatophores in the shallow subtidal zone, with large specimens near the seagrass ecosystem that surrounds the mangrove. For both species, a drug extraction protocol and an antibacterial experiment was performed. The extract of Suberites luna sp. nov. was found to be bioactive against recognized pathogens such as Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus and Enterococcus faecalis, but no bioactive activity was recorded for Chalinula qatari sp. nov. This study highlights the importance of increasing bioprospecting effort in hyperarid conditions and the importance of combining bioprospecting with taxonomic studies for the identification of novel marine drugs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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