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Enregistrement W3025956528 · doi:10.1101/2020.05.13.094649

Metabolite profiling of experimental cutaneous leishmaniasis lesions demonstrates significant perturbations in tissue phospholipids

2020· preprint· en· W3025956528 sur OpenAlexfundno aff
Adwaita R. Parab, Diane Thomas, Sharon Lostracco-Johnson, Jair L. Siqueira-Neto, James H. McKerrow, Pieter C. Dorrestein, Laura‐Isobel McCall

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésCutaneous leishmaniasisLesionMetaboliteLeishmaniasisDiseaseLeishmania majorPathogenesisLeishmaniaBiologyAdverse effectSecondary metaboliteMedicinePathologyImmunologyInternal medicineBiochemistryParasite hosting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Each year 700,000 to 1.2 million new cases of cutaneous leishmaniasis (CL) are reported and yet CL remains one of thirteen diseases classified as neglected tropical diseases (NTDs). Leishmania major is one of several different species of that same genus that can cause CL. Current CL treatments are limited by adverse effects and rising resistance. Studying disease metabolism at the site of infection can lead to new drug targets. In this study, samples were collected from mice infected in the ear and footpad with L. major and analyzed by untargeted liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Significant differences in overall metabolite profiles were noted in the ear at the site of the lesion. Interestingly, lesion-adjacent, macroscopically healthy sites also showed alterations in specific metabolites, including select phosphocholines (PCs). Host-derived PCs in the lower m/z range ( m/z 200-799) showed an increase with infection in the ear at the lesion site, while those in the higher m/z range ( m/z 800-899) were decreased with infection at the lesion site. Overall, our results expanded our understanding of the mechanisms of CL pathogenesis through the host metabolism and may lead to new curative measures against infection with Leishmania . Author summary Cutaneous leishmaniasis (CL) is one of thirteen neglected tropical diseases in the world today. It is an infectious disease with a wide distribution spanning five continents, with increasing distribution expected due to climate change. CL manifests as skin lesions and ulcers that are disabling and stigmatized. With the current treatment options being limited, studying host-pathogen metabolism can uncover mechanisms of disease pathogenesis that may lead to new curative measures against infection. In this paper we used untargeted metabolomics to address molecular-level changes occurring in vivo in experimental skin lesions of Leishmania major . Distinct global metabolic profiles were observed. Total phosphocholines (PCs) and those in the lower m/z ranges were significantly higher at the site of the skin lesion in the ear. In addition, specific PCs as well as PCs of varied m/z ranges were also affected at healthy-appearing lesion-adjacent sites, indicating that infection-induced metabolic perturbations are not restricted to the lesion site. Ultimately, these results provide essential clues to the metabolic pathways affected by CL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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