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Enregistrement W3026228641 · doi:10.1101/2020.05.17.20104729

Consensus study of risk factors and symptoms of SARS-CoV-2 (COVID-19) using biomedical literature and social media data

2020· preprint· en· W3026228641 sur OpenAlexaff
Jouhyun Jeon, Gaurav Baruah, Sarah Sarabadani, Adam Palanica

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueMisinformation and Its Impacts
Établissements canadiensMental Health Research Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineOutbreakRetrospective cohort studySocial mediaSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)DiseaseDemographyInternal medicinePathologyInfectious disease (medical specialty)Political science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background In December 2019, Coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak started in China and rapidly spread around the world. Lack of any vaccine or optimized intervention raised the importance of characterizing risk factors and symptoms for the early identification and successful treatment of COVID-19 patients. Methods We systematically integrated and analyzed published biomedical literature and public social media data to expand our landscape of clinical and demographic variables of COVID-19. Through semantic analysis, 45 retrospective cohort studies, which evaluated 303 clinical and demographic variables across 13 different outcomes of COVID-19, and 84,140 tweet posts from 1,036 COVID-19 positive users were collected. In total, 59 symptoms were identified across both datasets. Findings Approximately 90% of clinical and demographic variables showed inconsistency across outcomes of COVID-19. From the consensus analysis, we identified clinical and demographic variables that were specific for individual outcomes of COVID-19. Also, 25 novel symptoms that have been not previously well characterized, but were mentioned in social media. Furthermore, we observed that there were certain combinations of symptoms that were frequently mentioned together among COVID-19 patients. Interpretation Identified outcome-specific clinical and demographic variables, symptoms, and combinations of symptoms may serve as surrogate indicators to identify COVID-19 patients and predict their clinical outcomes providing appropriate treatments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,109
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,084

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,109
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0420,020
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,240
Tête enseignante GPT0,422
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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