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Enregistrement W3026727420 · doi:10.3389/fncel.2020.00103

Differential Expression of Acid – Sensing Ion Channels in Mouse Primary Afferents in Naïve and Injured Conditions

2020· article· en· W3026727420 sur OpenAlexafffund
Melina Papalampropoulou-Tsiridou, Simon Labrecque, Antoine G. Godin, Yves De Koninck, Feng Wang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular Neuroscience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensInstitut Universitaire en Santé Mentale de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésAcid-sensing ion channelSodium channelIon channelNeuroscienceIn situ hybridizationDorsal root ganglionSensory systemCalcitonin gene-related peptideBiologyMolecular biologyCell biologyMedicineInternal medicineGene expressionReceptorGeneChemistryGeneticsNeuropeptideSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Injury and inflammation cause tissue acidosis, which is a common feature of various painful conditions. Acid-Sensing Ion channels (ASICs) are amongst the main excitatory channels activated by extracellular protons and expressed in the nervous system. Six transcripts of ASIC subunits including ASIC1a, ASIC1b, ASIC2a, ASIC2b, ASIC3, and ASIC4 are encoded by four genes (Asic1-4) and have been identified in rodents. Most ASIC subunits are present at substantial levels in primary sensory neurons of dorsal root ganglia (DRG) except for ASIC4. However, their expression pattern in DRG neurons remains largely unclear, mainly due to the lack of antibodies with appropriate specificity. In this study, we examined in detail the expression pattern of ASIC1-3 subunits, including splice variants, in different populations of DRG neurons in adult mice using an in situ hybridization technique (RNAscope) with high sensitivity and specificity. We found that in nave condition, all five subunits examined were expressed in the majority of myelinated, NF200-immunoreactive, DRG neurons (NF200 + ). However, ASIC subunits showed a very different expression pattern among non-myelinated DRG neuronal subpopulations: ASIC1 and ASIC3 were only expressed in CGRP-immunoreactive neurons (CGRP + ), ASIC2a was mostly expressed in the majority of IB4-binding neurons (IB4 + ), while ASIC2b was expressed in almost all non-myelinated DRG neurons. We also found that at least half of sensory neurons expressed multiple types of ASIC subunits, indicating prevalence of heteromeric channels. In mice with peripheral nerve injury, the expression level of ASIC1a and ASIC1b in L4 DRG and ASIC3 in L5 DRG were altered in CGRP + neurons, but not in IB4 + neurons. Furthermore, the pattern of change varied among DRGs depending on their segmental level, which pointed to differential regulatory mechanisms between afferent types and anatomical location. The distinct expression pattern of ASIC transcripts in nave condition, and the differential regulation of ASIC subunits after peripheral nerve injury, suggest that ASIC subunits are involved in separate sensory modalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,434

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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