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Enregistrement W3026944009 · doi:10.1038/s41467-020-16352-z

Translational control of breast cancer plasticity

2020· article· en· W3026944009 sur OpenAlexafffund
Michael Jewer, Laura Lee, Matthew Leibovitch, Guihua Zhang, Jiahui Liu, Scott D. Findlay, Krista M. Vincent, Kristofferson Tandoc, Dylan Z. Dieters‐Castator, Daniela F. Quail, Indrani Dutta, Mackenzie Coatham, Zhihua Xu, Aakshi Puri, Bo‐Jhih Guan, Maria Hatzoglou, Andrea Brumwell, James Uniacke, Christos Patsis, Antonis E. Koromilas, Julia Schüler, Gabrielle M. Siegers, Ivan Topisirović, Lynne‐Marie Postovit

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensQueen's UniversityMcGill UniversityUniversity of GuelphUniversity of AlbertaWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesWomen and Children's Health Research InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondation du cancer du sein du QuébecFonds de Recherche du Québec - SantéAlberta Innovates - Health SolutionsCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Cancer FoundationChildren's Health Research InstituteAlberta InnovatesMcGill University
Mots-clésReprogrammingHomeobox protein NANOGBiologyCancer researchBreast cancerCancer stem cellCancer cellmicroRNAStem cellPI3K/AKT/mTOR pathwayCell biologyPhenotypeCancerSignal transductionCellInduced pluripotent stem cellGeneticsGeneEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plasticity of neoplasia, whereby cancer cells attain stem-cell-like properties, is required for disease progression and represents a major therapeutic challenge. We report that in breast cancer cells NANOG, SNAIL and NODAL transcripts manifest multiple isoforms characterized by different 5' Untranslated Regions (5'UTRs), whereby translation of a subset of these isoforms is stimulated under hypoxia. The accumulation of the corresponding proteins induces plasticity and "fate-switching" toward stem cell-like phenotypes. Mechanistically, we observe that mTOR inhibitors and chemotherapeutics induce translational activation of a subset of NANOG, SNAIL and NODAL mRNA isoforms akin to hypoxia, engendering stem-cell-like phenotypes. These effects are overcome with drugs that antagonize translational reprogramming caused by eIF2α phosphorylation (e.g. ISRIB), suggesting that the Integrated Stress Response drives breast cancer plasticity. Collectively, our findings reveal a mechanism of induction of plasticity of breast cancer cells and provide a molecular basis for therapeutic strategies aimed at overcoming drug resistance and abrogating metastasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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