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Enregistrement W3027119763 · doi:10.1101/2020.05.20.106500

A defect in COPI-mediated transport of STING causes immune dysregulation in COPA syndrome

2020· preprint· en· W3027119763 sur OpenAlexaff
Zimu Deng, Zhenlu Chong, Christopher S. Law, Kojiro Mukai, Frances O. Ho, Tereza Martinu, Bradley J. Backes, Walter L. Eckalbar, Tomohiko Taguchi, Anthony K. Shum

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity of California, San FranciscoCleveland Clinic FoundationSandler FoundationNational Heart, Lung, and Blood InstituteFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésStingCOPIGolgi apparatusCell biologyImmune dysregulationBiologyWild typeInterferonImmune systemMutantImmunologyEndoplasmic reticulumSecretory pathwayGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogenic COPA variants cause a Mendelian syndrome of immune dysregulation with elevated type I interferon signaling 1,2 . COPA is a subunit of coat protein complex I (COPI) that mediates Golgi to ER transport 3 . Missense mutations that disrupt the COPA WD40 domain impair binding and sorting of proteins targeted for retrieval to the ER but how this causes disease remains unknown 1,4 . Given the importance of COPA in Golgi-ER transport, we speculated that type I interferon signaling in COPA syndrome involves missorting of STING. Here we show that a defect in COPI transport due to mutant COPA causes ligand-independent activation of STING. Furthermore, SURF4 is an adapter molecule that facilitates COPA-mediated retrieval of STING at the Golgi. Activated STING stimulates type I interferon driven inflammation in Copa E241K/+ mice that is rescued in STING-deficient animals. Our results demonstrate that COPA maintains immune homeostasis by regulating STING transport at the Golgi. In addtion, activated STING contributes to immune dysregulation in COPA syndrome and may be a new molecular target in treating the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,554
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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