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Enregistrement W3027528681 · doi:10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.648.6

FOXC1 is Over‐expressed and is More Stable in Triple Negative/Basal‐Like Breast Cancer

2018· article· en· W3027528681 sur OpenAlexaff
Fahed Elian, Todd McMullen, David N. Brindley, Michael A. Walter

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerTriple-negative breast cancerCancer researchHepatocellular carcinomaBiologyCancerMedicineInternal medicineOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rapidly accumulating evidence implicates forkhead box C1 ( FOXC1 ) in Triple Negative Breast Cancer (TNBC), particularly in Basal‐Like Breast cancer (BLBC). Recently additional studies have demonstrating that FOXC1 is also a major player in hepatocellular carcinoma (HCC), endometrial cancer, Hodgkin's lymphoma (HL), non‐Hodgkin's lymphoma (NHL), and others. The FOXC1 gene encodes a transcription factor that is crucial to mesodermal, neural crest, and ocular development. Loss of function mutations in FOXC1 have been shown to cause autosomal dominantly inherited Axenfeld‐Rieger's Syndrome (ARS), a developmental disorder associated in eye anomalies and glaucoma. Interestingly, while FOXC1 missense mutations that cause ARS reduce FOXC1 activity, increased FOXC1 function now appears to be often linked to more aggressive cancer phenotypes in TN/BL‐BC, HCC, HL, and NHL. We have investigated the mechanism(s) by which FOXC1 activity is increased in BLBC. Samples were obtained from TNBC tumors, Triple Positive Breast Cancer (TPBC) tumors or from breast tissue from normal patients. Using quantitative PCR, we found that FOXC1 was significantly over‐expressed in TNBC patients as compared to controls. In contrast, FOXC1 mRNA was significantly less expressed in TPBC samples as compared to either control or TNBC samples. FOXC1 protein half‐life was significantly longer in the TNBC/BLBC cell lines (HS 587T and BT 549) compared to FOXC1 protein's half‐life in HeLa cells. Studies of FOXC1 Copy‐number variation (CNV) in TNBC/BLBC cell lines reveals that cell lines that have higher levels of FOXC1 protein (HS 587T, BT‐549) have extra copies of FOXC1 . This contrasts with a cell line with lower expression of FOXC1 protein, MDA‐MB‐231, which may be explained by a deletion of FOXC1 in this TNBC cell line. Our results suggest that increased FOXC1 function in TNBC/BLBC results from over‐expression of FOXC1 in tumors of TNBC patients that appears to be the result of changes to FOXC1 stability and amplification of FOXC1 copy number. We predict that understanding the mechanism(s) underlying FOXC1's activation in cancer could aid in designing improved therapies for TNBC patients. Support or Funding Information Verag Donation to MAW This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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