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Enregistrement W3027597407 · doi:10.1186/s12881-020-01041-x

Association of rs610604 in TNFAIP3 and rs17728338 in TNIP1 gene polymorphisms with psoriasis susceptibility: a meta-analysis of case-control studies

2020· review· en· W3027597407 sur OpenAlexaboutno aff
Hai-bo Gong, Shutao Gao, Xiongming Pu, Xiaojing Kang, Xiujuan Wu

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPsoriasisOdds ratioConfidence intervalCochrane LibraryMedicineInternal medicineGeneticsBioinformaticsOncologyImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: To date, the fundamental pathophysiology underlying the occurrence and progression of psoriasis are still unanswered questions. Genome-wide association surveys have revealed that TNFAIP3 and TNIP1 were key biomarkers for psoriasis. Here, we intended to conduct a survey on the association between TNFAIP3 and TNIP1 gene polymorphisms and psoriasis risk. METHODS: A comprehensive search of four online databases-China National Knowledge Infrastructure (CNKI), PubMed, Embase, and Cochrane Library was undertaken up to August 25, 2019. We chose allele genetic model to deal with the original data. Newcastle-Ottawa scale (NOS) was used to evaluate the risk bias of each study. The RevMan 5.3 software was used to calculate the combined odds ratio and 95% confidence interval. RESULTS: In total, we included 13 case-control studies consist of 13,908 psoriasis patients and 20,051 controls in this work. Our results demonstrated that rs610604 in TNFAIP3 polymorphism was significantly associated with psoriasis risk using random-effect model (G vs. T, OR = 1.19, 95% CI: 1.09-1.31, P = 0.0002), and a significant association between rs17728338 in TNIP1 polymorphism and psoriasis vulnerability using fixed-effect model (A vs. G, OR = 1.69, 95% CI:1.58-1.80, P < 0.00001). CONCLUSIONS: Our findings indicated that rs610604 in TNFAIP3 and rs17728338 in TNIP1 gene polymorphisms were associated with psoriasis susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,234
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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