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Enregistrement W3027608644 · doi:10.3897/bdj.8.e50837

Using online databases to produce comprehensive accounts of the vascular plants from the Brazilian protected areas: The Parque Nacional do Itatiaia as a case study

2020· article· en· W3027608644 sur OpenAlexaff
Marina Moreira, Tatiana Tavares Carrijo, Anderson Alves‐Araújo, André M. Amorim, Alessandro Rapini, Andrews V S da Silva, Braz A P Cosenza, Cláudia Regina Cachulo Lopes, Camila Nardy Delgado, Cíntia Kameyama, Dayvid Rodrigues Couto, Daniel Elias Ferreira Barbosa, Daniele Monteiro, Diego Rafael Gonzaga, Eduardo Dalcin, Elsie Franklin Guimarães, Elton John de Lírio, Fernando B. Matos, Fátima Regina Gonçalves Salimena, Felipe Alves de Oliveira, Gustavo Heiden, João Lanna, José Fernando A. Baumgratz, José Floriano Barêa Pastore, Juliana R P M Oliveira, Laísa Barcelos, Lana da Silva Sylvestre, Leandro Freitas, Leandro Lacerda Giacomin, Leandro Cardoso Pederneiras, Leonardo Dias Meireles, Lúcia G. Lohmann, Luciana Carvalho Pereira, Luís Alexandre Estevão da Silva, Luiz Menini Neto, Marcelo Cardoso de Souza, Marcelo Trovó, Marcos Sobral, Mário Luís Garbin, Mário Rui Gomes, Marli Pires Morim, Michelle Mota, Paulo H. Labiak, Pedro Lage Viana, Pedro Luís Rodrigues de Moraes, Renato Goldenberg, Rubens Luiz Gayoso Coelho, Samyra Gomes Furtado, Sebastião José da Silva-Neto, Thiago Bevilacqua Flores, Valquíria Ferreira Dutra, VINÍCIUS R. BUENO, Rafaela Campostrini Forzza

Notice bibliographique

RevueBiodiversity Data Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFern and Epiphyte Biology
Établissements canadiensFluidigm (Canada)
Organismes subventionnairesInstituto Chico Mendes de Conservação da BiodiversidadeUniversidade Federal do Espírito SantoFundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Espírito SantoFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mots-clésThreatened speciesGeographyBiodiversityIUCN Red ListData deficientVascular plantFernEcologyDatabaseBiologySpecies richnessHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Brazil is one of the most biodiverse countries in the world, with about 37,000 species of land plants. Part of this biodiversity is within protected areas. The development of online databases in the last years greatly improved the available biodiversity data. However, the existing databases do not provide information about the protected areas in which individual plant species occur. The lack of such information is a crucial gap for conservation actions. This study aimed to show how the information captured from online databases, cleaned by a protocol and verified by taxonomists allowed us to obtain a comprehensive list of the vascular plant species from the "Parque Nacional do Itatiaia", the first national park founded in Brazil. All existing records in the online database JABOT (15,100 vouchers) were downloaded, resulting in 11,783 vouchers identified at the species level. Overall, we documented 2,316 species belonging to 176 families and 837 genera of vascular plants in the "Parque Nacional do Itatiaia". Considering the whole vascular flora, 2,238 species are native and 78 are non-native. NEW INFORMATION: The "Parque Nacional do Itatiaia" houses 13% of the angiosperm and 37% of the fern species known from the Brazilian Atlantic Forest. Amongst these species, 82 have been cited as threatened, following IUCN categories (CR, EN or VU), seven are data deficient (DD) and 15 have been classified as a conservation priority, because they are only known from a single specimen collected before 1969.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,057

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0170,018
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,214
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,092 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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