Multiomics-based characterization of specialized metabolites biosynthesis in <i>Cornus Officinalis</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Cornus officinalis, an important traditional medicinal plant, is used as major constituents of tonics, analgesics, and diuretics. While several studies have focused on its characteristic bioactive compounds, little is known on their biosynthesis. In this study, we performed LC-QTOF-MS-based metabolome and RNA-seq-based transcriptome profiling for seven tissues of C. officinalis. Untargeted metabolome analysis assigned chemical identities to 1,215 metabolites and showed tissue-specific accumulation for specialized metabolites with medicinal properties. De novo transcriptome assembly established for C. officinalis showed 96% of transcriptome completeness. Co-expression analysis identified candidate genes involved in the biosynthesis of iridoids, triterpenoids, and gallotannins, the major group of bioactive metabolites identified in C. officinalis. Integrative omics analysis identified 45 cytochrome P450s genes correlated with iridoids accumulation in C. officinalis. Network-based integration of genes assigned to iridoids biosynthesis pathways with these candidate CYPs further identified seven promising CYPs associated with iridoids' metabolism. This study provides a valuable resource for further investigation of specialized metabolites' biosynthesis in C. officinalis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle