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Enregistrement W3027714814 · doi:10.1158/1055-9965.epi-20-0091

Associations between Genetically Predicted Blood Protein Biomarkers and Pancreatic Cancer Risk

2020· article· en· W3027714814 sur OpenAlexaff
Jingjing Zhu, Xiang Shu, Xingyi Guo, Duo Liu, Jiandong Bao, Roger L. Milne, Graham G. Giles, Chong Wu, Mengmeng Du, Emily White, Harvey A. Risch, Núria Malats, Eric J. Duell, Phyllis J. Goodman, Donghui Li, Paige M. Bracci, Verena Katzke, Rachel Ε. Neale, Steven Gallinger, Stephen K. Van Den Eeden, Alan A. Arslan, Federico Canzian, Charles Kooperberg, Laura E. Beane Freeman, Ghislaine Scélo, Kala Visvanathan, Christopher A. Haiman, Loı̈c Le Marchand, Herbert Yu, Gloria M. Petersen, Rachael Z. Stolzenberg‐Solomon, Alison P. Klein, Qiuyin Cai, Jirong Long, Xiao-Ou Shu, Wei Zheng, Lang Wu

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesPromises for PurpleJohns Hopkins UniversityNational Heart, Lung, and Blood InstituteLustgarten FoundationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthHarbin Medical University Cancer HospitalU.S. Department of Health and Human ServicesConquer Cancer FoundationWorld Health OrganizationHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésPancreatic cancerPancreatic ductal adenocarcinomaMedicineCancerBiomarkerOncologyInternal medicineBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the most lethal malignancies, with few known risk factors and biomarkers. Several blood protein biomarkers have been linked to PDAC in previous studies, but these studies have assessed only a limited number of biomarkers, usually in small samples. In this study, we evaluated associations of circulating protein levels and PDAC risk using genetic instruments. METHODS: To identify novel circulating protein biomarkers of PDAC, we studied 8,280 cases and 6,728 controls of European descent from the Pancreatic Cancer Cohort Consortium and the Pancreatic Cancer Case-Control Consortium, using genetic instruments of protein quantitative trait loci. RESULTS: , which has been implicated as a potential target gene of PDAC risk variant. Eight of the identified proteins (LMA2L, TM11D, IP-10, ADH1B, STOM, TENC1, DOCK9, and CRBB2) were associated with PDAC risk after adjusting for previously reported PDAC risk variants (OR ranged from 0.79 to 1.52). Pathway enrichment analysis showed that the encoding genes for implicated proteins were significantly enriched in cancer-related pathways, such as STAT3 and IL15 production. CONCLUSIONS: We identified 38 candidates of protein biomarkers for PDAC risk. IMPACT: This study identifies novel protein biomarker candidates for PDAC, which if validated by additional studies, may contribute to the etiologic understanding of PDAC development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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