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Enregistrement W3027752863 · doi:10.1074/jbc.ra120.013470

Genetically encoded intrabody sensors report the interaction and trafficking of β-arrestin 1 upon activation of G-protein–coupled receptors

2020· article· en· W3027752863 sur OpenAlexaff
Mithu Baidya, Punita Kumari, Hemlata Dwivedi‐Agnihotri, Shubhi Pandey, Badr Sokrat, Silvia Sposini, Madhu Chaturvedi, Ashish Srivastava, D. Roy, Aylin C. Hanyaloglu, Michel Bouvier, Arun K. Shukla

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilScience and Engineering Research BoardThe Wellcome Trust DBT India AllianceDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaNational Institute for Health and Care ResearchWellcome Trust
Mots-clésArrestinReceptorCell biologyG protein-coupled receptorProtein–protein interactionChemistryBiophysicsBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Agonist stimulation of G-protein-coupled receptors (GPCRs) typically leads to phosphorylation of GPCRs and binding to multifunctional proteins called β-arrestins (βarrs). The GPCR-βarr interaction critically contributes to GPCR desensitization, endocytosis, and downstream signaling, and GPCR-βarr complex formation can be used as a generic readout of GPCR and βarr activation. Although several methods are currently available to monitor GPCR-βarr interactions, additional sensors to visualize them may expand the toolbox and complement existing methods. We have previously described antibody fragments (FABs) that recognize activated βarr1 upon its interaction with the vasopressin V2 receptor C-terminal phosphopeptide (V2Rpp). Here, we demonstrate that these FABs efficiently report the formation of a GPCR-βarr1 complex for a broad set of chimeric GPCRs harboring the V2R C terminus. We adapted these FABs to an intrabody format by converting them to single-chain variable fragments and used them to monitor the localization and trafficking of βarr1 in live cells. We observed that upon agonist simulation of cells expressing chimeric GPCRs, these intrabodies first translocate to the cell surface, followed by trafficking into intracellular vesicles. The translocation pattern of intrabodies mirrored that of βarr1, and the intrabodies co-localized with βarr1 at the cell surface and in intracellular vesicles. Interestingly, we discovered that intrabody sensors can also report βarr1 recruitment and trafficking for several unmodified GPCRs. Our characterization of intrabody sensors for βarr1 recruitment and trafficking expands currently available approaches to visualize GPCR-βarr1 binding, which may help decipher additional aspects of GPCR signaling and regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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