S17. GLOBAL DNA METHYLATION IN CURRENT AND EMERGENT SUICIDAL IDEATION: ANALYSIS IN SCHIZOPHRENIA
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Several lines of evidence have shown that epigenetic mechanisms influence suicidal behavior, but do not indicate specific susceptibility variants. In a recent study, analysis of global methylation levels found that psychiatric patients with a history of suicide attempt (SA) had significantly higher levels of 5-methyl cytosine (5mC), suggesting that patients with a history of SA have global hypermethylation of their genome. However, there is no study investigated the link between global DNA methylation and suicidal ideation (SI) in schizophrenia. In this study, we analyzed global DNA methylation in suicide ideators and non-ideators in a sample of schizophrenia patients to find if global DNA methylation can predict SI in schizophrenia. Methods There are several methods of detecting total 5-methylcytosine content in the genome. We used Cell Biolabs’ Global DNA Methylation ELISA Kit, which is a competitive enzyme immunoassay developed for rapid detection and quantitation of 5’-methyl-2’-deoxycytidine (5MedCyd) in DNA extracted from white blood cells (WBC). We digested the genomic DNA, extracted from WBC, into single nucleotides and the quantity of 5MedCyd was determined by comparing its absorbance with that of a known 5MedCyd standard curve. We measured global DNA methylation in predicting current and emergent suicidal ideation. Results In the analysis of current SI in our schizophrenia patients, the average quantity of 5MedCyd was 7.56 ± 0.77 ng 5mC/µg DNA for suicide ideators and 8.72 ± 1.97 ng 5mC/µg DNA for non-ideators. There was no evidence of a significant difference between these two groups in our analysis (p=0.176). Also, we did not find a significant difference between global DNA methylation change (global DNA methylation change between baseline and three-month follow-up visits) in patients with and without emergent SI (p=0.121). Discussion This preliminary analysis did not find a predictive role of global DNA methylation in SI in patients with schizophrenia. The small sample size, used in this pilot study, is probably responsible for the fact that the results found here did not support those of previous research, showing that methylation levels are higher in patients with a history of a suicide attempt.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».