Effect of flavophospholipol on fecal microbiota in weaned pigs challenged with Salmonella Typhimurium
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The heightened prevalence of Salmonella Typhimurium remains a public health and food safety concern. Studies have reported antibiotic, flavophospholipol, may have the ability to reduce Salmonella in swine, as well as alter the gut microbiota in favour of beneficial bacteria by inhibiting pathogenic bacteria. Thus, the objective of this study was to investigate the fecal microbiota of weaned pigs receiving in-feed flavophospholipol and challenged with Salmonella Typhimurium. Results Twenty-one weaned pigs were fed either a diet containing 4 ppm of flavophospholipol (treatment group) or a non-medicated feed (control group) for 36 days post-weaning (Day 1 to Day 36). The pigs were orally challenged with a 2 mL dose of 10 8 CFU/mL of S. Typhimurium at Day 7 and Day 8. Community bacterial DNA extracted from fecal samples collected at Day 6 (before challenge) and Day 36 (28 days after challenge) were used to assess the fecal microbiota using the V4 region of the 16S rRNA gene with Illumina MiSeq next-generation sequencing. Sequencing data were visualized using mothur and analyzed in JMP and R software. The fecal microbiota of pigs in the treatment group had differences in abundance of phyla (Firmicutes, Proteobacteria) and genera ( Lactobacillus, Roseburia , Treponema, unclassified Ruminococcaceae, Blautia , Streptococcus , Megasphaera , Dorea , Sporobacter , Peptococcus , unclassified Firmicutes, Clostridium IV and Campylobacter) when compared to pigs that were controls, 28 days after challenge with Salmonella ( P < 0.05). Specifically, results demonstrated a significant increase in phylum Proteobacteria ( P = 0.001) and decrease in Firmicutes ( P = 0.012) and genus Roseburia ( P = 0.003) in the treated pigs suggestive of possible microbial dysbiosis. An increased abundance of genera Lactobacillus ( P = 0.012) was also noted in the treated group in comparison to the control. Conclusion Based on these findings, it is difficult to conclude whether treatment with 4 ppm of flavophospholipol is promoting favorable indigenous bacteria in the pig microbiota as previous literature has suggested.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».