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Enregistrement W3028232944 · doi:10.1038/s41467-020-15706-x

Multi-ancestry GWAS of the electrocardiographic PR interval identifies 202 loci underlying cardiac conduction

2020· review· en· W3028232944 sur OpenAlexaff
Ιωάννα Ντάλλα, Lu‐Chen Weng, James Cartwright, Amelia Weber Hall, Garðar Sveinbjörnsson, Nathan R. Tucker, Seung Hoan Choi, Mark Chaffin, Carolina Roselli, Michael R. Barnes, Borbála Mifsud, Helen Warren, Caroline Hayward, Jonathan Marten, James Cranley, Maria Pina Concas, Paolo Gasparini, Thibaud Boutin, Ivana Kolčić, Ozren Polašek, Igor Rudan, Nathalia Matta Araujo, Maria Fernanda Lima‐Costa, Antônio Luiz Pinho Ribeiro, Renan P. Souza, Eduardo Tarazona‐Santos, Vilmantas Giedraitis, Erik Ingelsson, Anubha Mahajan, Andrew P. Morris, Fabiola Del Greco M, Luisa Foco, Martin Gögele, Andrew A. Hicks, James P. Cook, Lars Lind, Cecilia M. Lindgren, Johan Sundström, Christopher P. Nelson, Muhammad Riaz, Nilesh J. Samani, Gianfranco Sinagra, Sheila Ulivi, Mika Kähönen, Pashupati P. Mishra, Nina Mononen, Kjell Nikus, Mark J. Caulfield, Anna F. Dominiczak, Sandosh Padmanabhan, May E. Montasser, Jeff O’Connell, Kathleen A. Ryan, Alan R. Shuldiner, Stefanie Aeschbacher, David Conen, Lorenz Risch, Sébastien Thériault, Nina Hutri‐Kähönen, Terho Lehtimäki, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Olli T. Raitakari, Catriona L. K. Barnes, Harry Campbell, Peter K. Joshi, James F. Wilson, Aaron Isaacs, Jan A. Kors, Cornelia M. van Duijn, Paul L. Huang, Vilmundur Guðnason, Tamara B. Harris, Lenore J. Launer, Albert V. Smith, Erwin P. Böttinger, Ruth J. F. Loos, Girish N. Nadkarni, Michael Preuß, Adolfo Correa, Hao Mei, James G. Wilson, Thomas Meitinger, Martina Müller‐Nurasyid, Annette Peters, Mélanie Waldenberger, Massimo Mangino, Timothy D. Spector, Michiel Rienstra, Yordi J. van de Vegte, Pim van der Harst, Niek Verweij, Stefan Kääb, Katharina Schramm, Moritz F. Sinner, Konstantin Strauch, Michael J. Cutler, Diane Fatkin, Barry London, Morten S. Olesen, Dan M. Roden, M. Benjamin Shoemaker, J. G. Smith, Mary L. Biggs, Joshua C. Bis, Jennifer A. Brody, Bruce M. Psaty, Kenneth Rice, Nona Sotoodehnia, Alessandro De Grandi, Christian Fuchsberger, Cristian Pattaro, Peter P. Pramstaller, Ian Ford, J. Wouter Jukema, Peter W. Macfarlane, Stella Trompet, Marcus Dörr, Stephan B. Felix, Uwe Völker, Stefan Weiß, Aki S. Havulinna, Antti Jula, Katri Sääksjärvi, Veikko Salomaa, Xiuqing Guo, Susan R. Heckbert, Henry J. Lin, Jerome I. Rotter, Kent D. Taylor, Jie Yao, Renée de Mutsert, Arie C. Maan, Dennis O. Mook‐Kanamori, Raymond Noordam, Francesco Cucca, Jun Ding, Edward G. Lakatta, Yong Qian, Kirill V. Tarasov, Daniel Levy, Honghuang Lin, Christopher Newton‐Cheh, Kathryn L. Lunetta, Alison D. Murray, David J. Porteous, Blair H. Smith, Bruno H. Stricker, André G. Uitterlinden, Marten E. van den Berg, Jeffrey Haessler, Rebecca D. Jackson, Charles Kooperberg, Ulrike Peters, Alex P. Reiner, Eric A. Whitsel, Álvaro Alonso, Dan E. Arking, Eric Boerwinkle, Georg Ehret, Elsayed Z. Soliman, Christy L. Avery, Stephanie M. Gogarten, Kathleen F. Kerr, Cathy C. Laurie, Amanda A. Seyerle, Adrienne M. Stilp, Solmaz Assa, M. Abdullah Said, M. Yldau van der Ende, Pier D. Lambiase, Michele Orini, Julia Ramírez, Stefan van Duijvenboden, Davíð O. Arnar, Daníel F. Guðbjartsson, Hilma Hólm, Patrick Sulem, Guðmar Þorleifsson, Rósa B. Þórólfsdóttir, Unnur Þorsteinsdóttir, Emelia J. Benjamin, Andrew Tinker, Kāri Stefánsson, Patrick T. Ellinor, Yalda Jamshidi, Steven A. Lubitz, Patricia B. Munroe

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversité LavalMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNovo Nordisk FondenBritish Heart FoundationBarts CharityMedical Research CouncilNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésGenome-wide association studyPR intervalAtrial fibrillationCardiologyEndophenotypeInternal medicineBrugada syndromeMedicineHeritabilityPopulationElectrical conduction system of the heartDiseaseGenetic associationGeneticsBiologySingle-nucleotide polymorphismElectrocardiographyGenotypeGeneHeart rateBlood pressure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The electrocardiographic PR interval reflects atrioventricular conduction, and is associated with conduction abnormalities, pacemaker implantation, atrial fibrillation (AF), and cardiovascular mortality. Here we report a multi-ancestry (N = 293,051) genome-wide association meta-analysis for the PR interval, discovering 202 loci of which 141 have not previously been reported. Variants at identified loci increase the percentage of heritability explained, from 33.5% to 62.6%. We observe enrichment for cardiac muscle developmental/contractile and cytoskeletal genes, highlighting key regulation processes for atrioventricular conduction. Additionally, 8 loci not previously reported harbor genes underlying inherited arrhythmic syndromes and/or cardiomyopathies suggesting a role for these genes in cardiovascular pathology in the general population. We show that polygenic predisposition to PR interval duration is an endophenotype for cardiovascular disease, including distal conduction disease, AF, and atrioventricular pre-excitation. These findings advance our understanding of the polygenic basis of cardiac conduction, and the genetic relationship between PR interval duration and cardiovascular disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,158
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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