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Enregistrement W3028436765 · doi:10.1002/rcm.8841

Matrix‐assisted laser desorption/ionization time‐of‐flight/time‐of‐flight tandem mass spectrometry (negative ion mode) of French Oak lignin: A novel series of lignin and tricin derivatives attached to carbohydrate and shikimic acid moieties

2020· article· en· W3028436765 sur OpenAlexaff
Abanoub Mikhael, Kristina Jurčić, Travis D. Fridgen, Michel Delmas, Joseph Banoub

Notice bibliographique

RevueRapid Communications in Mass Spectrometry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaWestern UniversityMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTricinChemistryLigninShikimic acidOrganic chemistryCarbohydrateConiferyl alcoholFlavonoid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rationale We report the top‐down lignomic analysis of the virgin released lignin (VRL) small oligomers obtained from French Oak wood. Methods We have used MALDI‐TOF‐MS in the negative ion mode for the analysis of the complex mixture of lignin oligomers extracted from French Oak wood. High‐energy CID‐TOF/TOF‐MS/MS analyses were used to support the postulated precursor ion structures. Results Twenty compounds were identified using MALDI‐TOF‐MS/MS of the VRL extracted from French Oak wood: seven tricin derivatives and/or flavonoids, three syringylglycerol derivatives, two syringol derivatives, two flavonolignin derivatives, and six miscellaneous compounds: luteoferol, lariciresinol isomer, 5‐hydroxy guaiacyl derivative, syringyl ‐C 10 H 10 O 2 dimer, trihydroxy benzaldehyde derivative, and aryl tetralin lignan derivative. Most of the identified compounds were in the form of carbohydrate and/or shikimic acid complexes. Conclusions The analysis of this complex mixture led to the identification of a series of lignin dimers, novel lignin‐carbohydrate complexes (LCC), and unique tricin derivatives linked to different types of carbohydrates and shikimic acid moieties. This finding supports the presence of lignin‐carbohydrate complexes in the isolated VRL. These analyses also showed that French Oak lignin is abundant in syringol moieties present in the lignin syringyl units or tricin derivatives. Moreover, the identification of some lignin‐carbohydrate and/or flavonoid‐shikimic acid complexes could provide new insight into the relationship between the biosynthesis of lignin and tricin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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