MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3028700216 · doi:10.1200/jco.2020.38.15_suppl.6580

Upfront DPYD genotyping and toxicity associated with fluoropyrimidine-based concurrent chemoradiotherapy for oropharyngeal carcinomas.

2020· article· en· W3028700216 sur OpenAlexaffabout
Antoine Desîlets, Houda Bahig, Olivier Ballivy, Danielle Charpentier, Édith Filion, Rahima Jamal, Louise Lambert, Charles Vadnais, Xiaoduan Weng, Denis Soulières

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensHôpital Notre-DameCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDPYDMedicineGenotypingOncologyInternal medicinePharmacogeneticsGenotypeGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

6580 Background: The combination of carboplatin and 5-fluorouracil (5-FU) is effective when used concurrently with radiotherapy for locoregionally advanced oropharyngeal carcinomas (Calais et al. 1999). DPYD polymorphisms can be associated with an increased risk of severe toxicity to fluoropyrimidines (Deenen et al. 2016). Upfront screening for the DPYD*2A allele is available in the province of Québec, Canada since March 2017. This study aimed to determine the effect of upfront genotyping on grade ≥3 toxicities. Methods: The studied population included all consecutive cases of oropharyngeal carcinomas treated with 5-FU based chemoradiotherapy one year before and after the implementation of upfront DPYD*2A genotyping. All patients were treated at the Centre Hospitalier de l’Université de Montréal (CHUM) between March 2016 and April 2018. Clinical data were extracted from chart review. Extended screening for 3 supplemental at-risk DPYD variants was also retrospectively performed in August 2019. Results: 181 patients were included in the analysis (87 patients before and 94 patients after DPYD*2A screening implementation). 91% of patients (n = 86) were prospectively genotyped for the DPYD*2A allele. Of those screened, 2% (n = 2/87) demonstrated a heterozygous DPYD*2A mutation. Those two patients received cisplatin-based treatment and thus avoided 5-FU toxicities. Extended genotyping of DPYD*2A-negative patients later allowed for the retrospective identification of 6 additional patients with alternative DPYD variants (two c.2846A > T and four c.1236G > A allele mutations). Conclusions: The DPYD*2A, c.2846A > T and c.1236G > A polymorphisms are associated with an increased risk of G3-4 toxicity to 5-FU, as well as higher hospitalization rates. Upfront DPYD genotyping can identify patients in whom fluoropyrimidine-related toxicity should be avoided. This represents an interesting addition in terms of pharmacovigilance. [Table: see text]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,069

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,201
Tête enseignante GPT0,447
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Oncology→Même sujetHead and Neck Cancer Studies→Travaux en français237 207→