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Enregistrement W3028997824 · doi:10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2018.03.009

Molecular epidemiological study on hepatitis C virus among drug users in Zhuhai, China

2018· article· en· W3028997824 sur OpenAlexaboutno aff
Hongxia Li, Quangde Wei

Notice bibliographique

RevueChinese Journal of Clinical Hepatology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNS5BHepatitis C virusVirologyGenotypeGenBankMolecular epidemiologyPhylogenetic treeHepatitis CEpidemiologyHepacivirusMedicineBiologyVirusGeneInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To investigate the molecular epidemiology of hepatitis C virus (HCV) among drug users in Zhuhai, China. Methods Anti-HCV and HCV RNA were detected by using ELISA and real-time RT-PCR respectively. HCV genotypes and subtypes were determined by direct sequencing of amplicons in partial NS5B regions and BLAST GenBank, followed by phylogenetic analysis. Results Of 435 blood plasma from drug users, 242 was negative for anti-HCV and HCV RNA, 147 were positive for anti-HCV and HCV RNA, 46 positive HCV RNA or anti-HCV. The infection rate of HCV was 44.37%. Three genotypes and five subtypes of HCV were detected in 78 samples of positive HCV RNA. Subtypes 6 a, 3b, 3 a, 1b and 1 a, were detected at frequencies of 60.26%, 15.38%, 14.10%, 6.41% and 3.85%, respectively. Compared with strains from Shenzhen, Foshan, Guangzhou, Shanwei, Hong Kong, Denmark, Canada, USA, United Kingdom, India and Nepal, HCV among drug users in Zhuhai were homophylic. Conclusions There were homology among HCV in drug users from Zhuhai and strains from some regions and countries. Subtype 6 a was the most predominant. Subtype 1 a and 3 a were discovered in Zhuhai. Key words: Drug users; HCV; Genotype; Phylogenetic tree; Homology

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,067

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,481
Écart entre enseignants0,400 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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