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Enregistrement W3029104222 · doi:10.1111/bjh.16724

The pyruvate kinase (PK) to hexokinase enzyme activity ratio and erythrocyte PK protein level in the diagnosis and phenotype of PK deficiency

2020· article· en· W3029104222 sur OpenAlexaff
Hanny Al‐Samkari, Kathryn Addonizio, Bertil Glader, D. Holmes Morton, Satheesh Chonat, Alexis A. Thompson, Kevin H.M. Kuo, Yaddanapudi Ravindranath, Heng Wang, Jennifer Rothman, Janet L. Kwiatkowski, Charles Kung, Penelope A. Kosinski, Hasan Al‐Sayegh, Wendy B. London, Rachael F. Grace

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Haematology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesAgios PharmaceuticalsAmerican Society of HematologyNational Hemophilia Foundation
Mots-clésPyruvate kinaseHexokinasePyruvate kinase deficiencyEnzymePhenotypeBiochemistryChemistryEndocrinologyInternal medicineGlycolysisMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diagnosis of pyruvate kinase deficiency (PKD), the most common cause of hereditary non-spherocytic haemolytic anaemia, remains challenging in routine practice and no biomarkers for clinical severity have been characterised. This prospective study enrolled 41 patients with molecularly confirmed PKD from nine North American centres to evaluate the diagnostic sensitivity of pyruvate kinase (PK) enzyme activity and PK:hexokinase (HK) enzyme activity ratio, and evaluate the erythrocyte PK (PK-R) protein level and erythrocyte metabolites as biomarkers for clinical severity. In this population not transfused for ≥90 days before sampling, the diagnostic sensitivity of the PK enzyme assay was 90% [95% confidence interval (CI) 77-97%], whereas the PK:HK ratio sensitivity was 98% (95% CI 87-100%). There was no correlation between PK enzyme activity and clinical severity. Transfusion requirements correlated with normalised erythrocyte ATP levels (r = 0·527, P = 0·0016) and PK-R protein levels (r = -0·527, P = 0·0028). PK-R protein levels were significantly higher in the never transfused [median (range) 40·1 (9·8-73·9)%] versus ever transfused [median (range) 7·7 (0·4-15·1)%] patients (P = 0·0014). The PK:HK ratio had excellent sensitivity for PK diagnosis, superior to PKLR exon sequencing. Given that the number of PKLR variants and genotype combinations limits prognostication based on molecular findings, PK-R protein level may be a useful prognostic biomarker of disease severity and merits further study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,529
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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