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Enregistrement W3029204028 · doi:10.1099/ijsem.0.004239

Sneathiella aquimaris sp. nov., isolated from aquaculture seawater

2020· article· en· W3029204028 sur OpenAlexfundno aff
Guizhen Li, Qiliang Lai, Peisheng Yan, Li Gu, Zongze Shao

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesScience and Technology Innovative Research Team in Higher Educational Institutions of Hunan ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’Exportation
Mots-clésBiology16S ribosomal RNAPhosphatidylglycerolPhylogenetic treeStrain (injury)MicrobiologyBacteriaOxidase testgenomic DNABotanyPhosphatidylcholineGeneGeneticsPhospholipidBiochemistryAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel marine bacterium, designated strain 216LB-ZA1-12 T , was isolated from a Penaeus vannamei aquaculture seawater sample. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences indicated that strain 216LB-ZA1-12 T belonged to the genus Sneathiella , with the highest sequence similarity to Sneathiella glossodoripedis MKT133 T (97.7 %), followed by Sneathiella limimaris GH1-24 T (97.0 %), Sneathiella chungangensis CAU 1294 T (96.6 %) and Sneathiella chinensis LMG 23452 T (96.1 %). The average nucleotide identity and the DNA–DNA hybridization estimate values between strain 216LB-ZA1-12 T and four close type strains were between 69.2–71.3% and 16.7–17.8 %, respectively. The bacterium was Gram-stain-negative, facultatively anaerobic, oxidase and catalase positive, oval- to rod-shaped, and motile. Growth was observed at pH 7–9, salinities of 1–15% and temperatures of 4–42 °C. The G+C content of the chromosomal DNA was 48.50 mol%. The major respiratory quinone was determined to be Q-10. The principal fatty acids were summed feature 8 (C 18 : 1 ω 7c/ ω 6c ) and C 16 : 0 . The major polar lipids were diphosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylglycerol, phosphatidylcholine and aminophospholipid. The combined genotypic and phenotypic data show that strain 216LB-ZA1-12 T represents a novel species within the genus Sneathiella , for which the name Sneathiella aquimaris sp. nov. is proposed, with the type strain 216LB-ZA1-12 T (=MCCC 1A14570 T =KCTC 72144 T ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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