Combining stable isotopes, morphological, and molecular analyses to reconstruct the diet of free‐ranging consumers
Notice bibliographique
Résumé
Accurate estimates of animal diet composition are essential to untangle complex interactions in food webs. Biomarkers and molecular tools are increasingly used to estimate diet, sometimes alongside traditional dietary tracing methods. Yet only a few empirical studies have compared the outcomes and potential gains of using a combination of these methods, especially using free-ranging animals with distinct foraging preferences.We used stable isotopes, morphological, and molecular analyses to investigate the diet of free-ranging consumers with two distinct diet types, that is, carnivore and omnivore. By combining the three analytical methods to assess the diet of consumers during the same period, we aimed to identify the limits of each method and to assess the potential benefits of their combined use to derive diet estimates.Our results showed that the different methods led to a consistent diet description for carnivores, which have a relatively simple diet mixture, but their outcomes somewhat differed for omnivore, which have a more complex diet. Still, the combined use of morphological and molecular analyses enhanced the diversity of food sources detected compared to the use of a single method independently of diet types. Precision of diet estimates derived from stable isotope analyses was improved by the addition of priors obtained from morphological and molecular diet analyses of the same population.Although we used free-ranging animals without a known diet, our empirical testing of three of the most widely used methods of diet determination highlights the limits of relying over a single approach, especially in systems with few or no a priori information about the foraging habits of consumers. The choice of an appropriate approach of diet description should be a key step when planning dietary studies of free-ranging populations. We recommend using more than one dietary determination methods especially for species with complex diet mixtures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».