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Enregistrement W3029435373 · doi:10.1101/2020.05.30.125237

PYCR1-dependent proline synthesis in cancer-associated fibroblasts is required for the deposition of pro-tumorigenic extracellular matrix

2020· preprint· en· W3029435373 sur OpenAlexaff
Emily Kay, Karla Paterson, David Sumpton, Claudia Boldrini, Juan R. Hernández‐Fernaud, Sandeep Dhayade, Ekaterina Stepanova, Enio Gjerga, Lisa J. Neilson, Sérgio Lilla, Ann Hedley, Grigorios Koulouras, Grace H. McGregor, Craig Jamieson, Radia Marie Johnson, Morag Park, Crispin Miller, Jurre J. Kamphorst, Fabricio Loayza‐Puch, Julio Sáez-Rodríguez, Karen Blyth, Michele Zagnoni, Sara Zanivan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesBeatson Institute for Cancer ResearchHorizon 2020 Framework ProgrammeStand Up To CancerEuropean CommissionNHS Greater Glasgow and ClydeCancer Research UKUniversity of Strathclyde
Mots-clésExtracellular matrixCancer cellGlutamineCancer researchCancer-Associated FibroblastsCancerStromaTumor microenvironmentChemistryBiologyCell biologyBiochemistryMedicineInternal medicineAmino acidImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TElevated production of collagen-rich extracellular matrix (ECM) is a hallmark of cancer associated fibroblasts (CAFs) and a central driver of cancer aggressiveness. How to target ECM production to oppose cancer is yet unclear, since targeting CAFs has been shown to restrain but also promote cancer progression. Metabolic rewiring is a hallmark of CAFs. Here we find that proline, which is a highly abundant amino acid in collagen proteins, is newly synthesised from glutamine to make tumour collagen in breast cancer xenografts, and that its production is elevated in breast cancer CAFs. PYCR1 is the rate-limiting enzyme for proline synthesis and is highly expressed in the tumour stroma of breast cancer patients and in CAFs. Reducing PYCR1 levels in CAFs is sufficient to reduce tumour collagen production, tumour growth and metastatic spread in vivo and cancer cell proliferation in vitro. PYCR1 and COL1A1 are overexpressed in patients with invasive ductal carcinoma with poor prognosis. Both collagen and glutamine-derived proline synthesis in CAFs are enhanced by increased pyruvate dehydrogenase-derived acetyl-CoA levels, via gene expression regulation through the epigenetic regulator histone acetyl transferase EP300. Altogether, our work unveils unprecedented roles of CAF metabolism to support pro-tumorigenic collagen production. PYCR1 is a recognised cancer cell vulnerability and potential target for therapy, hence, our work provides evidence that targeting PYCR1 in tumours may have the additional benefit of halting the production of pro-tumorigenic ECM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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