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Enregistrement W3029708229 · doi:10.1093/femsec/fiaa074

Pretreatment of crop residues by ammonia fiber expansion (AFEX) alters the temporal colonization of feed in the rumen by rumen microbes

2020· article· en· W3029708229 sur OpenAlexafffund
Stephanie A. Terry, Gabriel O Ribeiro, Cheyenne C. Conrad, K. A. Beauchemin, Tim A. McAllister, Robert J. Gruninger

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésRumenBiologyPrevotellaColonizationAgronomyFibrobacter succinogenesCropCrop residueRuminococcusAnimal scienceBacteriaFermentationMicrobiologyFood scienceBiochemistryEcologyGut flora

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study examines the colonization of barley straw (BS) and corn stover (CS) by rumen bacteria and how this is impacted by ammonia fiber expansion (AFEX) pre-treatment. A total of four ruminally cannulated beef heifers were used to investigate in situ microbial colonization in a factorial design with two crop residues, pre-treated with or without AFEX. Crop residues were incubated in the rumen for 0, 2, 4, 8 and 48 h and the colonizing profile was determined using 16 s rRNA gene sequencing. The surface colonizing community clustered based on incubation time and pre-treatment. Fibrobacter, unclassified Bacteroidales, and unclassified Ruminococcaceae were enriched during late stages of colonization. Prevotella and unclassified Lachnospiraceae were enriched in the early stages of colonization. The microbial community colonizing BS-AFEX and CS was less diverse than the community colonizing BS and CS-AFEX. Prevotella, Coprococcus and Clostridium were enriched in both AFEX crop residues, while untreated crop residues were enriched with Methanobrevibacter. Several pathways associated with simple carbohydrate metabolism were enriched in the primary colonizing community of AFEX crop residues. This study suggests that AFEX improves the degradability of crop residues by increasing the accessibility of polysaccharides that can be metabolized by the dominant taxa responsible for primary colonization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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