Pretreatment of crop residues by ammonia fiber expansion (AFEX) alters the temporal colonization of feed in the rumen by rumen microbes
Notice bibliographique
Résumé
This study examines the colonization of barley straw (BS) and corn stover (CS) by rumen bacteria and how this is impacted by ammonia fiber expansion (AFEX) pre-treatment. A total of four ruminally cannulated beef heifers were used to investigate in situ microbial colonization in a factorial design with two crop residues, pre-treated with or without AFEX. Crop residues were incubated in the rumen for 0, 2, 4, 8 and 48 h and the colonizing profile was determined using 16 s rRNA gene sequencing. The surface colonizing community clustered based on incubation time and pre-treatment. Fibrobacter, unclassified Bacteroidales, and unclassified Ruminococcaceae were enriched during late stages of colonization. Prevotella and unclassified Lachnospiraceae were enriched in the early stages of colonization. The microbial community colonizing BS-AFEX and CS was less diverse than the community colonizing BS and CS-AFEX. Prevotella, Coprococcus and Clostridium were enriched in both AFEX crop residues, while untreated crop residues were enriched with Methanobrevibacter. Several pathways associated with simple carbohydrate metabolism were enriched in the primary colonizing community of AFEX crop residues. This study suggests that AFEX improves the degradability of crop residues by increasing the accessibility of polysaccharides that can be metabolized by the dominant taxa responsible for primary colonization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».