Cranberry-Derived Proanthocyanidin and Its Gut Microbial Metabolites Affect the Intestinal miRNome in a Distinct Manner In Vitro
Notice bibliographique
Résumé
Polyphenols are emerging as novel prebiotic compounds. Cranberries are a rich source of polyphenols, such as proanthocyanidin (PAC), which has known benefits including anti-cancer properties. In the colon, PACs are catabolized by the gut microbiota into 3,4-dihydroxyphenylacetic acid (DHPAA) and 3-(4-hydroxyphenyl) propionic acid (HPPA), which may mediate prebiotic effects. Mechanisms are unknown but may involve host microRNA (miRNA). The objective of this study was to investigate the effects of nutritionally relevant doses of cranberry PAC, DHPAA, and HPPA on the human intestinal miRNome. Differentiated Caco-2BBe1 colonic epithelial cells, a morphologically homogenous subclone of Caco-2 cells, were treated with cranberry extract containing 94% PAC (Ocean Spray Cranberries, 50 μg/ml), DHPAA, HPPA (5 μg/ml) or control vehicle (Dulbecco's Modified Eagle Medium) for 24 hours. Experiments were repeated 3 times. Cell viability was assessed by fluorescence microscopy. Cell RNA was extracted and used for miRNA profiling via NanoString Technology. Data were processed and normalized in nSolverTM 4.0, statistics and hierarchical clustering were done with R and ClustVis. Gene targets were predicted with miRNet and pathway enrichment analysis was done in PathDIP. The treatments had no effect on cell viability. Of the 829 miRNAs assessed, 248 were expressed. Five miRNAs were differentially expressed among groups (ANOVA, P < 0.01; FDR < 5%). Unsupervised hierarchical clustering with these miRNAs revealed perfect separation based on treatment. These miRNAs were found to target 686 genes, enriched in 116 KEGG pathways including “miRNAs in cancer” and “pathways in cancer”. Treatment-specific responses included increased miR-2116-5p, miR-6721-5p, and miR-1290 for PAC, DHPAA, and HPPA, respectively. Pathways in glucagon signaling and central carbon metabolism in cancer were enriched in response to DHPPA only. Cranberry PAC and polyphenol metabolites at concentrations representing dietary intakes elicit different miRNA signatures in colonic cells, providing a novel mechanism to explain their effects on intestinal health. Cranberry-mediated miRNA modulation may represent a potential strategy for preventing chronic disease. NSERC, Ocean Spray Cranberries, Inc., NSERC Graduate Scholarship.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».