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Enregistrement W3030044401 · doi:10.12688/f1000research.23663.2

Identifying and understanding factors that affect the translation of therapies from the laboratory to patients: a study protocol

2020· preprint· en· W3030044401 sur OpenAlexafffund
Manoj M. Lalu, Joshua Montroy, C. Glenn Begley, Tania Bubela, Victoria Hunniford, David Ripsman, Neil Wesch, Jonathan Kimmelman, Malcolm Macleod, David Moher, Alvin Tieu, Lindsey Sikora, Dean Fergusson

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal testing and alternatives
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityMcGill UniversityOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineClinical trialTranslational researchClinical study designPreclinical researchProtocol (science)Medical physicsPathologyAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The process of translating preclinical findings into a clinical setting takes decades. Previous studies have suggested that only 5-10% of the most promising preclinical studies are successfully translated into viable clinical applications. The underlying determinants of this low success rate (e.g. poor experimental design, suboptimal animal models, poor reporting) have not been examined in an empirical manner. Our study aims to determine the contemporary success rate of preclinical-to-clinical translation, and subsequently determine if an association between preclinical study design and translational success/failure exists. Methods: Established systematic review methodology will be used with regards to the literature search, article screening and study selection process. Preclinical, basic science studies published in high impact basic science journals between 1995 and 2015 will be included. Included studies will focus on publicly available interventions with potential clinical promise. The primary outcome will be successful clinical translation of promising therapies - defined as the conduct of at least one Phase II trial (or greater) with a positive finding. A case-control study will then be performed to evaluate the association between elements of preclinical study design and reporting and the likelihood of successful translation. Discussion: This study will provide a comprehensive analysis of the therapeutic translation from the laboratory bench to the bedside. Importantly, any association between factors of study design and the success of translation will be identified. These findings may inform future research teams attempting preclinical-to-clinical translation. Results will be disseminated to identified knowledge users that fund/support preclinical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,143
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,137
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,757

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1430,137
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,005
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,011
Bibliométrie0,0080,007
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0060,009
Science ouverte0,0050,006
Intégrité de la recherche0,0110,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0680,023

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,666
Tête enseignante GPT0,524
Écart entre enseignants0,142 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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