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Enregistrement W3030703577 · doi:10.3760/cma.j.issn.2095-4255.2016.09.003

The first detection of Babesia genotype from tick at Alataw Pass, China-Kazakhstan border

2016· article· en· W3030703577 sur OpenAlexaboutno aff
Dan Luo, Xiaoping Yin, Andong Wang, Yanhe Tian, Zhen Liang, Te Ba, Zhang JiangGuo

Notice bibliographique

RevueChin J Endemiol · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBabesia18S ribosomal RNABiologyTickGenotypePhylogenetic treeVeterinary medicinePolymerase chain reactionHomology (biology)VirologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To investigate the infection state and genotype of Babesia from tick at Alataw port, the China-Kazakhstan border. Methods Drag-flag method and animal body surface method were used to collect ticks at Ebinur Lake wetland, Alataw port. 18s rRNA gene of Babesia was tested by polymerase chain reaction (PCR), the sequence analysis was conducted with Blast and phylogenetic analysis was conducted with Mega 6.0. Results The positive rate of Babesia gene in ticks was 12.65% (32/253) at Alataw port. By sequencing, 32 sequences were divided in ALSK174, ALSK191, ALSK019 three groups. Analysis of Blast showed that ALSK174 had the highest homology with Babesia caballi (EU888904, South Africa), it was 99.72% (356/357); ALSK191 had the highest homology with Babesia occultans (KP745626, Turkey), it was 99.72% (350/351); ALSK019 had 95.76% (339/354) homology with Babesia odocoilei (KC460321, Canada). Conclusion In this study, we have first reported that the Babesia is infected from ticks at Alataw port, the China-Kazakhstan border. Key words: Babesia; Hyalomma asiaticum asiaticum; Haemaphysalis erinacei; Polymerase chain reaction

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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