Suitability and Sufficiency of Telehealth Clinician-Observed, Participant-Collected Samples for SARS-CoV-2 Testing: The iCollect Cohort Pilot Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The severe acute respiratory coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemic calls for expanded opportunities for testing, including novel testing strategies such as home-collected specimens. OBJECTIVE: We aimed to understand whether oropharyngeal swab (OPS), saliva, and dried blood spot (DBS) specimens collected by participants at home and mailed to a laboratory were sufficient for use in diagnostic and serology tests of SARS-CoV-2. METHODS: Eligible participants consented online and were mailed a participant-collection kit to support collection of three specimens for SARS-CoV-2 testing: saliva, OPS, and DBS. Participants performed the specimen collection procedures during a telehealth video appointment while clinical observers watched and documented the suitability of the collection. The biological sufficiency of the specimens for detection of SARS-CoV-2 by reverse transcriptase-polymerase chain reaction and serology testing was assessed by laboratorians using visual inspection and quantification of the nucleic acid contents of the samples by ribonuclease P (RNase P) measurements. RESULTS: Of the enrolled participants,153/159 (96.2%) returned their kits, which were included in this analysis. All these participants attended their video appointments. Clinical observers assessed that of the samples collected, 147/153 (96.1%) of the saliva samples, 146/151 (96.7%) of the oropharyngeal samples, and 135/145 (93.1%) of the DBS samples were of sufficient quality for submission for laboratory testing; 100% of the OPS samples and 98% of the saliva samples had cycle threshold values for RNase P <30, indicating that the samples contained sufficient nucleic acid for RNA-PCR testing for SARS-CoV-2. CONCLUSIONS: These pilot data indicate that most participant-collected OPS, saliva, and DBS specimens are suitable and sufficient for testing for SARS-CoV-2 RNA and serology. Clinical observers rated the collection of specimens as suitable for testing, and visual and quantitative laboratory assessment indicated that the specimens were biologically sufficient. These data support the utility of participant-collected and mailed-in specimens for SARS-CoV-2 testing. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): RR2-10.2196/19054.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».