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Enregistrement W3030872057 · doi:10.1002/jrsm.1425

Development and validation of study filters for identifying controlled non‐randomized studies in <scp>PubMed</scp> and Ovid <scp>MEDLINE</scp>

2020· article· en· W3030872057 sur OpenAlexaff
Siw Waffenschmidt, Tamara Navarro, Nick Hobson, Elke Hausner, Stefan Sauerland, R. Brian Haynes

Notice bibliographique

RevueResearch Synthesis Methods · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensMcMaster UniversityHamilton Health SciencesImpact
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMEDLINEComputer scienceRandomized controlled trialMedical physicsFilter (signal processing)MedicineInformation retrievalSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A retrospective analysis published by the German Institute for Quality and Efficiency in Health Care (IQWiG) in 2018 concluded that no filter for non-randomized studies (NRS) achieved sufficient sensitivity (≥92%), a precondition for comprehensive information retrieval. New NRS filters are therefore required, taking into account the challenges related to this study type. Our evaluation focused on the development of study filters for NRS with a control group ("controlled NRS"), as this study type allows the calculation of an effect size. In addition, we assumed that due to the more explicit search syntax, controlled NRS are easier to identify than non-controlled ones, potentially resulting in better performance measures of study filters for controlled NRS. Our aim was to develop study filters for identifying controlled NRS in PubMed and Ovid MEDLINE. We developed two new search filters that can assist clinicians and researchers in identifying controlled NRS in PubMed and Ovid MEDLINE. The reference set was based on 2110 publications in Medline extracted from 271 Cochrane reviews and on 4333 irrelevant references. The first filter maximizes sensitivity (92.42%; specificity 79.67%, precision 68.49%) and should be used when a comprehensive search is needed. The second filter maximizes specificity (92.06%; precision 82.98%, sensitivity 80.94%) and should be used when a more focused search is sufficient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,518
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,745
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,482
Score d'incertitude au seuil0,594

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,5180,745
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,016
Bibliométrie0,0320,017
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0090,009
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0070,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,899
Tête enseignante GPT0,652
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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