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Enregistrement W3031342953 · doi:10.1136/bmjopen-2019-032729

Population Registry of Esophageal and Stomach Tumours in Ontario (PRESTO): protocol for a multicentre clinical and pathological database including 25 000 patients

2020· article· en· W3031342953 sur OpenAlexaffabout
Vaibhav Gupta, Jordan Levy, Catherine Allen-Ayodabo, Elmira Amirazodi, Laura Davis, Qing Li, Alyson Mahar, Natalie G. Coburn

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEsophageal Cancer Research and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of ManitobaInstitute for Clinical Evaluative SciencesSunnybrook Health Science CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCancer registryPopulationEsophageal cancerDiseaseIncidence (geometry)DatabaseEpidemiologyHealth careFamily medicinePathologicalCancerGeneral surgeryInternal medicineEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Oesophagogastric cancers carry a high mortality, economic burden and rising incidence. There is a need to monitor and improve care for this disease. Pathologic information is a cornerstone of cancer diagnosis, treatment and prognosis. Few population-based studies combine pathology information and clinical outcomes. The objective of this study is to develop a clinical and pathological database of oesophagogastric cancers to study practice patterns, resource utilisation and clinical outcomes. METHODS AND ANALYSIS: The Population Registry of Esophageal and Stomach Tumours in Ontario (PRESTO) will include all patients with oesophagogastric cancer diagnosed from 2002 onwards within the province of Ontario. We estimate that the sample over the first 14 years of the study will include 26 000 patients. Pathologic information from diagnostic procedures, endomucosal resection specimens and surgical resection specimens is being abstracted into a purpose-built database. Pathology information will be linked to administrative data, which capture baseline demographics, patient-reported symptoms, physician billings, hospital visits, hospital characteristics, geography and vital statistics. The registry will be updated prospectively. ETHICS AND DISSEMINATION: Ethics approval for this study was obtained from the Sunnybrook Health Sciences Centre Research Ethics Board. The PRESTO database will enable the study of oesophagogastric cancer in Ontario under six themes of inquiry: treatment, surgical outcomes, pathology, survival, health system and resource utilisation and cost. This information will be a valuable addition to the global efforts to understand ways to optimise care for these diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,540
Score d'incertitude au seuil0,916

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0050,012
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,276
Tête enseignante GPT0,515
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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