MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3031485295 · doi:10.1002/jmv.26128

Establishment of a cell‐based quantitative reverse transcription‐polymerase chain reaction (RT‐qPCR) assay for detection of multivalent rotavirus vaccine

2020· article· en· W3031485295 sur OpenAlexaff
Yunjin Wang, Yueyue Liu, Mingqiang Wang, Li Yu, Chao Ma, Xiongxiong Li, Tai L. Guo, Kuiying Kou, Yueru Chen, Hanbo Gong, Xu Z

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Virology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRotavirusTaqManVirologySerial dilutionTiterPotencyBiologyReverse transcriptaseRotavirus vaccineVero cellReal-time polymerase chain reactionPlaque-forming unitReverse transcription polymerase chain reactionPolymerase chain reactionMolecular biologyVirusCell cultureIn vitroMessenger RNAGeneMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Because of deficiencies of traditional potency tests in rotavirus detection, a one‐step TaqMan probe‐based quantitative reverse transcription‐polymerase chain reaction (RT‐qPCR) assay combined with cell‐based method was established to determine the infectious potency of the target virus in multivalent live rotavirus vaccines in vitro. Series dilutions of rotavirus samples were inoculated into Vero cells and cultured for 24 hours. The cells were lysed and the potency was detected by RT‐qPCR. The reference standards with a known titer (lgCCID50/mL) were assayed in parallel, and the potencies of each sample were determined using parallel line method. The specificity, precision and accuracy of the assay were evaluated, respectively. The results showed that messenger RNA produced during rotavirus replication was the primary template of RT‐qPCR and the primers and probes were specific to each strain. The coefficient of variation of different wells and different working days did not exceed 6% and the results of the assay were proved to be concordant with those of cell culture infective dose 50% with a relative deviation less than 5%. This assay is a more rapid, cost‐effective and high‐throughput way for detecting multivalent rotavirus vaccine, and will be a valuable tool in the quality control and stability monitoring of live multivalent rotavirus vaccine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Medical VirologyMême sujetViral gastroenteritis research and epidemiologyTravaux en français237 207